基于分子模拟技术的化学修饰酶热稳定性机理研究

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该文以胰蛋白酶和α-胰乳蛋白酶为模型酶,用分子模拟技术研究亲水化修饰酶稳定性提高的机理.首先,从天然胰蛋白酶和α-胰蛋白酶的晶体结构出发,运用CVFF力场,对修饰前后酶分子空间结构进行合理建模.再采用四种溶剂化能模型(Ooi模型、Vila模型、W-E-1模型和W-E-2模型)计算了以上两种酶修饰前后其溶剂化能变化.对溶剂化能与酶热稳定性关系进行了深入分析,发现Ooi模型、W-E-1模型和W-E-2模型的计算结构能用来定性预测这两种酶亲水化修饰前后的热稳定性变化,进而从理论上证实了亲水化修饰的实验结果.单甲氧基聚乙二醇(MPEG)作为一种广泛使用的修饰剂,也被经常用来提高酶的热稳定性.该文用四种不同分子量的MPEG(分五最分别为350、750、2000和5000)对胰蛋白酶进行化学修饰实验研究,MPEG活化方法采用对硝基苯甲氧酯法.对胰蛋白酶MPEG修饰前后实验测得的热失活数据进行了失活过程的动力学及热力学分析,其动力学模型既能考虑酶的内在热失活,也能考虑酶的自水解效应.为了进一步了解MPEG修饰提高酶稳定性的机理,用分子模拟对修饰前后的胰蛋白酶的空间结构变化进行了研究.通过MPEG(分子量为350)修饰前后的分子模拟研究进一步证实了失活过程动力学及热力学分析得到MPEG修饰提高酶热稳定性的分子机制.
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