月季TFL1和SOC1基因的克隆及载体构建

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月季花是四大切花之一,花型优美,花香淡雅。利用技术手段,人为干预月季开花,就可以获得更高的经济价值、药用价值和观赏价值。开花调控途径主要包括光周期途径,春花途径,自主途径,赤霉素途径四种,它们彼此相互作用,相互交联,共同作用于植物的开花调节。本实验成功提取了山西农业大学校园内种植的月季的RNA,并克隆了两种调控开花的基因TFL1与SOC1的cDNA。利用生物信息学分析技术,对其基因序列、氨基酸序列、及蛋白质的二级、三级结构进行比较分析。分别构建了TFL1与SOC1基因的表达载体。1提取月季总RNA,反转录合成cDNA,利用Primer Premier & Oligo软件设计TFL1基因cDNA的特异引物,上游引物:TFL1f 5’-GCTCAAGGAAAACAGAAAAGGAT-3’,下游引物:TFL1r 5’-CAGAAGCATCACTTGGTTGTTTATC-3’,采用PCR技术扩增出了月季开花基因TFL1的cDNA,大小为899bp。利用Primer Premier & Oligo软件设计SOC1基因的cDNA的特异引物,上游引物:SOC1f 5’-GTAGATTGCTTTTGAGAAC CCATTTG-3’,下游引物:SOC1r 5’-CAGAACATACGCAAAACAATCGGC-3’,采用PCR技术扩增出了SOC1基因的cDNA,大小为725bp。2通过生物信息学分析,山西农业大学校园内种植的月季的开花基因TFL1与NCBI网站上刊登的Rosa hybrid cultivar RhTFLl (TFL1)(登陆号JF806626.1)的同源率为99%,有三个碱基发生变化。通过模拟蛋白质的结构,二级结构分析表明,两者在α螺旋,β折叠上存在较小差异;模拟的三级结构与数据库中已建模的基因序列比对,两者部分基因序列与数据库中部分信息匹配,建模发现已存在的部分三级结构之间没有明显差异。SOC1基因与NCBI网站上刊登的Rosa hybrid cultivar SOC1-like protein (SOC1)gene (登录号JF806633.1)的同源率为99%,有三个碱基发生变化。通过模拟蛋白质的结构,二级结构分析表明,两者在α螺旋,β折叠上存在细微差异;模拟三级结构与数据库中已建模的基因序列比对,两者部分基因序列与数据库中信息匹配,建模发现已存在的部分三级结构之间有明显差异。蛋白质的折叠及空间构象决定其功能,一个突变位点位于为SOC1基因的核心区域。SOC1基因属于植物开花整合子基因的重要成员。由此推断,山西农业大学校园内种植的月季花期改变可能由于SOC1基因突变造成的。3 TA质粒经过PCR鉴定结果符合预期要求。使用Kpn I和Sal I双酶切体系构建了pCAMBIA2300-TFL1载体;使用Kpn 1和Xho I双酶切体系构建了PMV-SOC1载体。
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