长度较短的两条单链DNA结合和分离的动力学研究

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近年来,单分子技术得到了快速的发展,越来越多的研究者开始使用单分子操纵来研究生物大分子。DNA分子是生物体的重要组成部分,在生物体进行复制、转录、翻译的过程中起着重要的作用,使遗传信息在RNA和蛋白质等生物大分子间转移。  双链DNA形成的动力学过程对生物进程和生物传感器有着重要影响。人们通常使用荧光标记的方法来研究这个形成过程。本文利用磁镊技术来研究两条单链DNA的结合和分离,研究这个动力学过程时单链DNA并不需要荧光标记,将有28个碱基的单链DNA和磁球相连,然后通过磁镊对磁球施加一个作用力,通过磁铁控制力的大小,溶液中的单链DNA可以和受力单链DNA自由结合、分离。我们就能观察到一个简单的两态模型,得出它们分离速率和结合速率跟力的依赖关系。然后改变溶液中单链DNA的碱基个数对DNA的两个速率进行测量,在测量速率和力的依赖关系的同时我们也对浓度和速率的依赖关系进行了测量;还测试了另一种只有26个碱基的单链DNA,反应过程中形成第二种有气泡结构的双链DNA,然后对比两种结构的差异。  在研究力和速率的依赖过程中,我们发现实验的能量分布曲线并不能用传统的理论模型来解释,所以可能需要给出新的模型来解释有力作用时,两条DNA分离的模型;在研究浓度和速率的依赖过程中,当改变碱基个数时,浓度和速率的关系跟第一种结构相比较有很微小的变化,但是也基本符合传统理论,分离速率不受到浓度影响,结合速率成正比。在后续的实验中将会继续改变碱基个数来观察这两个速率的变化。以后的工作中我们也可能会改变温度来对这两个速率进行测量。
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