城市轨道交通与常规公交是城市公共交通系统的两大主体，应该通过有效的运营组织协调管理，从竞争走向联合，共同发展，最大限度地提高城市公共交通系统的运营效率，共建公交出行在城市出行中的主体地位。轨道交通与常规公交运营组织协调以现代化管理手段和现代信息技术为基础，通过运能匹配、调度计划协调等手段来实现两大公共交通方式的协同发展，保证乘客乘坐公交在出行过程中的连续性、顺畅性，实现轨道交通与常规公交的一体化运营，并最大限度地发挥城市公共交通系统的整体效能。但城市轨道交通与常规公交运营组织协调研究属于复杂大系统协同发展的问题，涉及的因素众多，各因素错综复杂。　　本文首先从城市轨道交通与常规公交的交通特性及其功能定位分析、轨道交通沿线客流分布特征以及换乘站客流时间分布特征三个方面分析了城市轨道交通与常规公交服务特性，论证了两者换乘协调的可行性。接着，从运营组织协调的内涵、原则、措施以及前提条件等方面分析了城市轨道交通与常规公交的理论基础。　　然后，以两条轨道交通及其与之有换乘关系的常规公交网络为对象，分析了轨道交通与常规公交运营组织协调原理。同时，分别对轨道交通换乘站、一般换乘站、轨道交通端点折返站换乘协调的临界条件进行了分析，对不同类型的换乘站点的常规公交和轨道交通之间换乘、常规公交线路间换乘以及轨道交通内部之间的换乘等提出了不同的换乘协调策略和计算换乘期望时间的方法。　　之后，分别分析了乘客出行成本分中的候车时间成本、在车时间成本、换乘时间成本以及企业运行成本中的轨道交通运营成本、常规公交运营成本的计算方法。考虑了轨道交通时段内的客流方向性，根据历史客流确定换乘协调主方向，对主协调方向和非协调方向的换乘时间提出了不同的计算方法，并按客流权重分别计算换乘协调方向和非协调方向的换乘时间成本。建立了以乘客的时间费用和公交企业运营费用的总成本最小化为目标的协调控制运营计划优化模型以及非协调控制运行计划模型。最后，建立算例，利用遗传算法对模型进行求解，得到一组线路最优发车间隔以及换乘线路之间的最优到离站时间间隔，并对比了协调与非协调控制状态下的系统成本，得出了协调控制计划模型较优的结论。