研究特征基因的恒温扩增技术及其在食源性致病微生物检测中的应用

来源 :华南师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kmyzchenpeng
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单增李斯特菌是最常见的食品致病菌的一种,由于其通过食品传播而导致人类患上李斯特菌病,因此为了保证食品的安全,快速的、高特异性且高灵敏度地检测单增李斯特菌方法已成为科学研究的热点话题。在本研究中,我们将超分支滚环扩增技术与基于磁珠的电化学发光技术相结合来提出一种恒温的、高灵敏度和高特异性的方法来对单增李斯特菌进行检测。首先,我们设计一个线性的锁式探针,这个锁式探针能识别单增李斯特菌的特征基因hly目标序列并被Taq DNA连接酶所连接,当连接完成便进行消化反应,当消化反应完成,一个用生物素标记的引物和钌标记的引物就以环为模板进行超分支滚环扩增反应。超分支滚环扩增的产物又被抓到表面包被有连霉亲和素的磁珠上从而被用来进行电化学发光检测。通过这种方法,用合成的DNA目标序列其灵敏度达到了10aM,将其用于单增李斯特基因组检测时,其灵敏度达到了0.0002 ng/μl。这个方法之所以能够达到如此高的灵敏度一方面是因为超分支滚环扩增有很强的扩增能力,另一方面是因为目前建立的基于磁珠的电化学发光平台有很高的灵敏度。   由于关于DNA序列的数据的不断丰富与快速发展,在现代生物科学领域,对于核酸的检测越来越重要。这里我们提出了一种恒温的基于哑铃的循环滚环扩增的技术来高灵敏度的检测核酸序列的方法。这种方法利用了DNA杂交的特性以及Bst DNA聚合酶的内在功能。这个检测体系包含了一个哑铃探针、一个短的引物和聚合酶。DNA杂交导致改变构象的特点能够使哑铃探针的茎部分打开,,打开之后,露出了引物结合位点,这样引物就能退火结合在环状探针上来引起扩增。一方面,扩增过程中Bst DNA聚合酶能将目标序列置换掉,另一方面,结合在环上的引物能够继续向前进行滚环扩增。接下来,这个被置换掉的目标序列又能去打开下一个哑铃,如此被重复循环利用。我们提出的方法能够检测到1fM的DNA目标序列。我们在此论文中演示了在这个方法中,能够使目标序列循环利用和滚环扩增结合起来,达到了更好的扩增效果。
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