本研究利用SSR分子标记技术,对比研究了三亚铁炉港的白骨壤和正红树种群的遗传多样性、不同年龄阶段的亚种群间的遗传分化、交配系统、花粉流和种子流以及小尺度的空间遗传结构,以及云霄白骨壤种群的遗传多样性和种群间的遗传分化,主要结果如下:(1)在铁炉港,正红树的遗传多样性(I=1.082,He=0.541)高于白骨壤(I=0.644,He=0.393),不同年龄阶段的亚种群间的遗传分化均不显著。铁炉港的白骨壤种群遗传多样性显著高于云霄种群,且单倍型种类比云霄多一种,两种群间出现显著遗传分化。(2)正红树的多位点异交率(tm=1.055±0.111)高于白骨壤(tm=0.742±0.212),正红树的双亲近交率(tm-ts=-0.050)低于白骨壤(tm-ts=0.111),高水平的异交率和低水平的双亲近交率是正红树遗传多样性更高的原因之一。(3)白骨壤的平均花粉流和种子流大于正红树。通过对种子进行父本分析计算母树与父本之间的距离为花粉流(白骨壤88.9 m,正红树34.3 m),对幼苗进行亲本分析,计算幼苗与母本的距离为种子流(白骨壤37.3 m,正红树20.0 m)。(4)正红树的空间遗传结构强度(Sp=0.083)略高于白骨壤(Sp=0.072),正红树种群在0～12 m的距离内具有显著的空间遗传结构,而白骨壤在0～24 m的距离内具有显著的空间遗传结构。(5)白骨壤在适应上更倾向于以量取胜的r对策,而正红树更倾向于以质取胜的K对策。综上,铁炉港的白骨壤和正红树在生态对策、交配系统和基因流(包括花粉流和种子流)上差异显著,作为嗜热性窄布种的正红树比抗寒性广布种的白骨壤具有更高的遗传多样性水平,由此推测演替中后期的建群种正红树正在逐渐取代演替初期的先锋种白骨壤。