目的：研究中药连翘提取物对脓毒症大鼠肝组织基因表达的影响,从基因水平上探讨连翘治疗脓毒症可能的作用机制。方法：雄性SD大鼠210只,随机分为模型组(n=90)、连翘组(n=90)和对照组(n=30),模型组和连翘组又根据取材时间(24h、48h、72h)分为3个亚组,每个亚组30只。采用盲肠结扎穿孔术(cecal ligation puncture,CLP)制备脓毒症模型,连翘组尾静脉注射连翘提取物溶液2.5ml/kg,每12小时一次；模型组及对照组给予同等体积生理盐水。模型组和连翘组不同亚组分别于造模后24h、48h、72h断头处死大鼠,无菌条件下切取右上叶肝组织,无RNase生理盐水清洗后,置于液氮中保存备用。对照组于相同条件下切取大鼠肝组织,保存于液氮备用。应用RatGenome2302.0大鼠基因表达谱芯片检测并分析各组大鼠肝组织的基因表达情况,以基因表达的倍数变化(fold change)>2或<-2且p<0.05异基因筛选标准,通过计算机筛选出差异表达的基因,并通过美国国立生物技术信息中心(NCBI)数据库查询基因功能并加以分类。结果：与对照组比较,模型24h组筛选出差异表达基因671条,已知功能基因667条,其中上调基因439条,下调基因228条；模型48h组筛选出差异表达基因133条,其中上调基因55条,下调基因78条；模型72h组筛选出差异表达基因204条,其中上调基因89条,下调基因115条。与同时间点模型组比较,连翘24h组筛选出差异基因2条,表达均上调；连翘48h组筛选出差异基因52条,已知功能基因51条,其中上调基因34条,下调基因17条；连翘72h组筛选出差异基因71条,其中上调基因38条,下调基因33条。模型组/对照组表达上调而连翘组／模型组表达下调基因14条,模型组/对照组表达下调而连翘组/模型组表达上调基因11条。基因功能主要涉及免疫反应、物质能量代谢、细胞信号转导、细胞周期调控、物质运输、细胞粘附等方面。结论：1.脓毒症时肝组织大量基因异常表达,涉及不同的分子功能,并参与多个生物学过程,提示脓毒症是一个涉及多因子、多基因、多种信号途径共同调控的复杂过程。2.连翘提取物能调控脓毒症模型大鼠部分异常表达基因发生回归,尤其是部分免疫炎症相关基因及代谢相关基因,能够调节机体免疫平衡紊乱,避免过度炎症反应,纠正Th1/Th2比例失衡,改善T细胞对特异性抗原刺激的低反应性,避免出现免疫麻痹；调节机体糖脂代谢,维持血糖稳定,降低血脂肪酸水平,改善高胰岛素血症及胰岛素抵抗状态。此外,还可维持内环境稳定,抑制细胞凋亡,促进机体自身修复,促使脓毒症大鼠多系统功能恢复正常。