细胞因子白介素IL-21活性增强的In Silico研究

来源 :华中师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sgrwflh
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
细胞因子白介素-21是近年来报道的I型细胞因子家族之一,具有多种生物学功能,其中最为显著的特点是能调节B细胞、CD4+T细胞的免疫活性。因此研究如何提高IL-21的生物活性将为开发成用于临床治疗抗肿瘤抗感染药物提供了可能。随着计算机的发展,计算机分子模拟技术广泛应用于计算化学、计算生物学、药物分子设计等领域,它从分子水平上研究结构与功能的关系,并不受样品制备和测试技术的限制,为科研工作者提供更多的数据参考和理论指导。因此,本论文主要运用计算机分子模拟技术具体从以下两方面来研究如何提高IL-21的活性:(1)从单克隆抗体出发,由于本实验组发现了一株命名为KJ的克隆体能特异性地识别细胞因子(如IL-21)并增强其生物活性,而另外一株单抗KI对IL-21没有功能增强性作用,这一发现为我们开展关于功能增强性抗体的增强作用机制的研究奠定了重要的物质基础。本论文从结构研究出发,来探究单抗KJ是如何增强hIL-21活性的。我们主要运用分子对接技术获得KJ/hIL-21、KI/hIL-21复合物结构,并发现KJ、KI与hIL-21对接后的结合位点不同,导致单抗与hIL-21结合后的构象有很大差异。同时采用Markov State Models动力学方法分析发现KJ/hIL-21比KI/hIL-21稳定,且用Transcomp方法分析发现KJ与hIL-21结合的静电相互作用更强。(2)从hIL-21单体出发,由于有文献已报道hIL-21的一个突变体显示比hIL-21有十倍的增效性,受此启发,我们将本实验室得到的一系列突变体(分别命名为Chimera2、Chimera4)运用同源模建方法得出三维空间结构。并通过MSMs分析,我们发现合理设计之后得到的突变体比WT(野生型)hIL-21更加优越,突变体C4产生的暂态状态数比hIL-21的少,因此C4比野生型hIL-21稳定,从而提高了hIL-2I的活性。由于突变体C2又比C4稳定,我们就可以预测C2对hIL-21的活性影响更大。
其他文献
金属在自然界广泛存在,对生命、环境、医学和工农业生产都有重要的意义,其中许多金属离子在生命过程中也负有不可替代的调控作用。但不可忽视,金属的过度开采和不合理利用已造成严重的环境污染问题,特别是一些重金属离子及过渡金属离子对生命系统也产生了相当的危害。荧光化学传感器能够将识别信息转换成易被感知的荧光信号,具有灵敏性好、选择性高、检测快速、检出限低等特点,可广泛应用于生物、环境检测和污水处理等领域。利
1971年3月的一天,野戰某师农场学生连四班的全体人员(还包括带头的军人二排长),在巩乃斯河肖尔布拉克对岸区域执行劳动任务期间,全都像发了疯似的扔下手中的劳动工具,置劳动任务于不顾,鬼使神差一般奔向河边,有的跳进河里,有的在河边到处搜寻,好像那里藏着万两黄金!尤其是二排长,非但不予制止,反而身体力行,带头违反纪律。致使一个上午白白浪费,什么劳动也没干……更为奇怪的是,这件事发生后,一贯严格的、原则
期刊
固体表面的浸润性决定着它们自身的应用与价值,近年来超疏水材料已经在生产生活领域展现出其巨大的潜在用途。而铜和铝材料是工业国防领域的主导材料,但它们仍然面临着磨损和腐蚀两大严重问题。基于这些问题,本文采用不同的表面制备技术,分别在铜和铝表面构建了三种具有不同表面几何形貌的仿生超疏水复合结构,进而考察了各个样品的摩擦学性能、耐酸碱腐蚀性能以及超疏水稳定性。主要研究内容和结果如下:1.通过两步溶液浸泡过