流感是人类历史上最重要的流行病之一,给人类牛命健康带来了很大的灾难,尤其2003年以来高致病性禽流感H5N1的频繁爆发使得流感病毒的研究再次成为热点.流感测序序列日益增加,已经有三万多条序列完成测序,构建可用于比较分析的专业流感病毒数据库已经成为必需.在此基础上,我们构建了流感病毒数据库IVDB,它整合了所有公共数据库中的数据、信息,并整合开发了一系列工具,使其成为流感病毒遗传、基因组、系统进化等分析的平台. IVDB包含了北京基因组研究所测序的流感全基因组数据,同时还收集、整理、注释公共数据库中的流感病毒序列数据,通过我们开发的质量过滤系统 O-Filter根据核酸序列的内容及其完整性对序列进行分类与整理.IVDB还提供了一系列工具和可视化视图用于病毒基囚组的进化分析、遗传多态性分析及进化分析:开发的搜索系统可以使用户通过设定各种组合选项得到自己所需数据;为方便全球病毒传播、流行趋势及进化分析的研究,我们开发了流感序列分布工具IVDT用于展示用户所选数据的地区分布;提供比较分析工具BLAST、多序列比对工具及构建系统进化树工具的在线使用;同时,IVDB还提供了我们分析的核酸及蛋白序列多态性分析数据,包括SNP分布图及次等位基因分布图.流感病毒数据库IVDB的文章已经在2007年1月份的核酸研究数据库专刊上公开发表. 在构建的IVDB基础上,我们又将在流感病毒序列突变导致蛋白结构改变的预测与模拟、流感蛋白与人或其他寄主之间的蛋白相互关系、流感抗原识别位点epitope预测等方面展开进一步分析.