卡介苗(Bacillus Calmette-Guerin，BCG)是唯一一种用来预防结核病的疫苗。为了对BCG苗的体外进化历程以及BCG的分子减毒机制进行深入研究，我们对卡介苗美国株(BCG Tice)进行全基因组测序后基因组补缺口(补洞)工作，以得到它的基因组完整序列。BCG属于高GC含量的革兰氏阳性细菌，其基因组GC含量高达65％，这给后期基因组补缺口阶段造成了很大的难度。　　 本研究首先对BCG Tice进行高通量测序，使用SOAPdenovo软件对得到的数据进行拼接。由于在高通量测序的过程中基因组某些区域测序覆盖度低，测序质量差会使测序结果经拼接之后形成众多的重叠群(contig)，相邻的位置关系确定的contig形成一个scaffold，contig之间未测到的区域为缺口序列(gap)，在contig末端设计引物进行PCR扩增，得到连接相邻contig的PCR产物，对PCR产物进行测序。通过优化PCR引物设计策略，尝试不同的聚合酶进行聚合反应，调整PCR反应条件并结合PCR产物构建克隆测序等方法，补齐contig之间的缺口序列。并对BCG Tice基因组进行了基本的生物信息学分析。以参照菌株BCG Pasteur基因组序列为引物设计模板进行补缺口引物设计，完成了BCG Tice的全基因组测序，得到了它的基因组完整序列，序列已提交到美国国立生物技术信息中心(NCBI)的GenBank数据库。对于GC含量高、基因组较稳定的菌株，以参考序列为模板设计引物进行序列补缺口证明是一种很好的策略，并可推广到其他高GC含量的细菌的补缺口工作中，对BCG Tice基因组序列的比较分析可以进一步揭示BCG基因组之间的差异，从而为更好地设计预防结核病的疫苗提供更多的参考与思路。