基于m~6A去甲基化酶调控脱氧核酶的构建与分析应用

来源 :武汉大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bm_imba
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
去甲基化酶参与的N6-甲基腺苷(N6-Methyladenine,m~6A)脱甲基过程是表观遗传学中的一个重要研究部分,m~6A去甲基化酶是一类重要的表观遗传学蛋白酶,与生命体的发生发展过程紧密相关。实现活细胞内去甲基化酶的高效原位检测具有重要意义,但是目前缺乏一种简便的、灵敏的检测工具。脱氧核酶(DNAzyme)是一种具有催化活性的DNA分子,已经被广泛用于生物传感和临床诊断等领域。对DNAzyme活性的调控主要是通过化学和光刺激这两种手段,而利用生物内源重要大分子对DNAzyme的活性进行直接调控未见有报道,这在响应性DNAzyme活性调控方面留下了一大空缺。针对以上问题,本论文开发了一个细胞内去甲基化酶调控的DNAzyme用于肿瘤细胞内去甲基化酶成像分析和功能调控。(1)发展了一种自激活的去甲基化酶调控的DNAzyme反馈系统。在研究中,发现DNAzyme催化活性中心的一个特定位点的m~6A修饰可以使其活性显著抑制。本文通过体外筛选得到了一个精确的m~6A高效封闭的DNAzyme,基于去甲基化酶FTO可以将m~6A脱甲基,使DNAzyme恢复到原本的结构而恢复活性,构建了一种对去甲基化酶高效、灵敏响应的DNAzyme探针,这种去甲基化酶激活的DNAzyme放大器能够剪切双标的底物,产生荧光信号,从而对活细胞中的FTO进行准确的监测成像,和小分子抑制剂的筛选和检测。同时,在DNAzyme剪切底物上整合一段具有基因沉默作用的反义核酸,可以实现去甲基化酶激活DNAzyme剪切底物释放反义核酸,达到细胞内去甲基化蛋白酶的敲低,以实现定向的基因调控,最终导致肿瘤细胞的凋亡。作为一种直接、无损的m~6A去除策略,该去甲基化酶激活的DNAzyme探针为细胞内难检测的(去)修饰蛋白酶检测提供了一种通用策略,同时为(去)甲基化酶的抑制剂高通量筛选提供了一个简单、高效的工具。(2)进一步为了扩展去甲基化酶高效的检测手段和肿瘤细胞精确检测,构建了一个FTO蛋白和microRNA共刺激响应的纳米机器。将DNAzyme催化中心的特定位点用m~6A修饰,封闭DNAzyme的原始活性,同时用封闭链与DNAzyme杂交,形成双链。只有在microRNA的作用下,发生toehold介导的链置换反应,释放单链状态的DNAzyme,使m~6A有效被FTO蛋白识别并去甲基激活,此时DNAzyme恢复活性,剪切金纳米颗粒上荧光标记的底物,产生荧光信号。因此只有在FTO蛋白和microRNA同时存在时,才能激活纳米机器,输出荧光信号,实现肿瘤细胞的精确鉴别。对比传统的单肿瘤标志物的检测,这一设计降低了阳性背景信号,提高了肿瘤诊断的准确性。结合熵驱动链置换反应和DNAzyme双重信号放大,将核酸探针限定在金纳米颗粒表面,可以极大地加快反应速率和提高检测灵敏度。成功实现了microRNA的高灵敏度和高特异性分析,并且可以根据microRNA和FTO蛋白的表达差异区分不同种类的肿瘤细胞。最重要的是,该工作弥补了当前细胞内FTO蛋白高效检测的空白。并且提供了一种新型的特定肿瘤细胞高表达的FTO蛋白和microRNA检测结合策略,为实现肿瘤细胞的多重、精准检测提供新的思路。
其他文献
锂离子电池(LIBs)因具有高效能、自放电小、无记忆效应和绿色环保等优势,广泛应用于交通、医疗和储能等领域,长期以来都是新能源方向的研发热点。锂离子电池用钛酸锂(Li4Ti5O12,LTO)负极材料因具有高且稳定的平台电压和“零应变”特性,可满足大功率用电设备安全性和稳定性的要求,发展潜力巨大。然而,钛酸锂负极材料的本征电子电导率和锂离子扩散速率较差、理论容量小,导致倍率性能差、体积能量密度低,限
钙离子结合蛋白S100A10作为S100家族中重要成员,分子内部钙离子结合结构域某些重要氨基酸替换将导致其对钙离子不敏感,处于永久活化状态。S100A10通常与Annexin A2形成紧密的异源四聚体发挥作用,主要定位于细胞膜结构,尤其是细胞质膜以及早期胞内体膜,也可以分泌到细胞外基质,广泛参与一系列细胞生命活动,包括离子通道的运输以及定位、膜受体的定位、胞吞作用、胞吐作用、细胞膜结构重组、细胞骨
农田土壤碳库是土壤碳库中最活跃的组分,它随着农田种植和管理制度的变化作出快速响应,因此具有极大的固碳潜力,有助于实现我国的“碳中和”目标。土壤有机碳(soil organic carbon,SOC)含量及其变化直接反映了农田土壤碳的固定或流失。因此,监测农田SOC的空间分布有利于保障粮食安全和预测全球气候变化。当前数字土壤制图主要依赖SOC和环境变量之间的相关性,即使用易于获取的环境变量来预测SO
滑坡灾害的隐蔽性强、破坏性大,给人民生命财产安全造成了巨大的威胁。滑坡体的表面形变是分析滑坡稳定性和危害性、预警垮塌灾害最重要的信息之一,对潜在滑坡识别、滑坡稳定性监测以及垮塌灾害预测具有重要意义。星载雷达遥感几乎不受夜晚以及天气影响,覆盖范围大、测量精度高,相比于地面传统测量以及机载星载光学遥感具有其独特的优势。星载雷达遥感技术正越来越多地应用在潜在滑坡识别、滑坡形变监测以及灾害预警方面。在实际
《古今韻會舉要》,簡稱《韻會》,宋末元初黃公紹編著、熊忠舉要。此書承《禮部韻略》舊制,並據時音作了改良,本文研究的就是時音層面(以下稱語音)的若干問題及與之相關的,包括“字母韻”、《七音韻》等基本概念。與以往相對單一平面的研究不同,本文側重從史的角度觀照《韻會》,扎根於歷史語境,給《韻會》以合理的歷史定位,並以歷史發展的、全局系統的眼光看待《韻會》中出現的語音現象,對它們作細緻描寫,充分聯繫語音史
当今的遥感对地观测能力达到空前水平,可获取的遥感数据呈指数增长,但由于目前地面数据处理能力不足导致遥感大数据的“数据海量、信息淹没”问题日益突出。因此,如何利用新兴的科学技术和手段,实现遥感影像感兴趣目标或区域的快速定位和智能检索,是遥感大数据处理和分析的重大需求,也是遥感影像处理领域亟待解决的重大挑战。基于内容的遥感影像检索通过提取的影像低层视觉特征实现遥感数据的查询与检索,是解决遥感数据组织与
背景:离体肺灌注(Ex vivo lung perfusion,EVLP)已发展成为评估边缘供肺最有效的技术。本研究试图建立EVLP系统,并用液体净化技术延长EVLP的运行时间至12小时,取代定期更换灌流液的方式,减少EVLP运行成本。第一部分方法:将实验猪随机分为对照组和热缺血组。热缺血组采用交流电诱导室颤方法使猪心跳停止,并在热缺血一小时后进行供肺获取;对照组则在麻醉后常规开胸获取供肺。两组供
戏曲舞蹈是戏曲表演中程式化身段动作组合化合的舞蹈化表现。戏曲舞蹈的形成可追溯到中国舞蹈的演变历程中,宋代的“队舞”表演中就蕴含着中国戏曲舞蹈元素的萌芽。元杂剧和南戏中舞蹈表演被逐渐吸收而演变为戏曲艺术的重要表现手段。明代以后,伴随着昆曲等剧种载歌载舞表演方式的形成,戏曲舞蹈开始走向成熟。至清代乾嘉时期,戏曲舞蹈的表演体系已较为完善。而戏曲舞蹈也成为明清以来中国舞蹈的主要形态。戏曲舞蹈的审美特征主要
学位
目的原发性肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是全球最常见、致死率最高的恶性肿瘤之一。HCC具有很高的血管侵袭及转移潜能,且缺乏早期诊疗的生物标志物,因此多数预后不良。HBV是HCC发生发展的一个重要危险因素之一。HBV的感染能导致慢性肝炎,并通过趋化因子诱导各类炎症细胞因子分泌、集聚及相互作用,导致肝细胞增殖与转化以及血管生成增多,最终导致HCC的发生发展。人趋化