垃圾露天堆放区渗滤液中原核生物的系统发育多样性

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由于传统微生物技术的不足,局限了我们对垃圾堆填区中古细菌和真细菌多样性的研究。本文中采用不依赖于纯培养的分子生物学方法对深圳过桥窝垃圾露天堆放区渗滤液中的古细菌和真细菌群落的结构和多样性进行了研究。应用基于16SrDNA的方法分别建立古细菌和真细菌两个文库。在古细菌文库中,10个序列型代表了总共的97个克隆子,这10个序列型分属古细菌界的两个门:Euryarchaeota和Crenarchaeota,其中有代表了96个克隆子的9个序列型均属于Euryarchaeota,仅有1个序列型属于Crenarchaeota,且没有纯培养与之相似。而在真细菌文库中,69个序列型代表了总共的155个克隆子,其中55个序列型共135个克隆子,占总克隆子的87.1%,均属于Firmicutes,说明此类真细菌在该露天堆放区的生物降解中可能起着重要的作用,剩余的20个克隆子则分属Proteobacteria(5.1%),Bacteroidetes(2.6%),Chlamydiae/Verrucomicrobiagroup(1.2%),Planctomycetes(1.2%),Actinobacteria(<1%)。虽然本研究中所获得的一部分序列与一些已经发表通过传统方法分离鉴定所得的序列相近,但还有大部分序列是与已经发表的序列表现出很低的相似性,这说明垃圾露天堆放区中的古细菌和真细菌多样性远比预期的复杂,对这方面的研究还很不足够。
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