在知识经济时代和经济全球化的今天，科学技术日益成为推动一个地区经济发展的根本动力，决定着一个地区的竞争能力和发展潜力，而创新能力亦成为决定一个区域经济增长的关键因素。因地制宜地创建区域创新系统，已成为许多地区制定经济政策的战略工具。因此，在区域创新系统的构建过程中，如何确定区域创新系统的发展进程、找出存在的问题、提出改进的方向，从而逐步完善区域创新系统是值得研究的重要课题。本文的研究在区域创新系统的特征、结构和运行原理的基础上，深入系统地研究区域创新能力的基本概念、测定指标和测定方法，并应用到浙江省不同地区的创新能力评价和对比分析中，从而为浙江省区域创新系统的完善提供理论和方法指导。　　 首先，本文在总结区域创新系统的相关理论研究成果的基础上，对区域创新系统和区域创新能力理论进行全面的介绍，明确其概念、内涵、特征和种类等基本的理论问题，及对区域经济的促进作用原理。其次，本文构建了区域创新能力评价的指标体系，从四大方面对区域创新能力进行评价；介绍了因子分析方法和数学模型。最后，本文对浙江省11个市区域创新能力进行了因子分析，从四个角度两个年度的数据进行了横向和纵向进行比较研究，找出了对应区域创新能力的影响因素，并提出相应对策措施。　　 综上所述，本文从区域创新的基本理论出发，深入研究区域创新系统内创新资源配置的相关理论与方法，将浙江省11个市区域创新能力的比较作为实证研究的对象，探讨区域创新能力不同组成部分的影响因素，并提出相应的对策建议。但由于区域创新能力指标的复杂性，笔者还需要作大量的研究与实践工作以期能不断的完善和改进。