作为中心法则的一个结论：从DNA转录到RNA，RNA翻译到蛋白质。RNA被认为是一类把遗传信息传递到蛋白质的简单的生物分子。然而近几年来，研究人员估计虽然绝大部分的真核生物的基因组都发生了转录，但是其中有接近97％的基因组并不编码蛋白，因此人们对于RNA的认识，迅速地从一个信息分子转变为一个具有结构、信息、催化等多重功能的分子。　　 本文的工作涉及了非编码RNA研究的三个方面，第一：收集了目前所有提交到NCBI上的非编码RNA数据，建立了一个二级数据库NONCODE，该数据库不仅提供非编码RNA的基本信息，包括物种、类别、长度、序列等，还根据文献提供了二级注释，主要是非编码RNA的功能、在细胞过程中扮演的角色、作用方式、二级结构等。除此之外，NONCODE数据库根据非编码RNA的功能过程提出一个标准的分类系统PFCLASS，试图解决目前非编码RNA分类的混乱状态；第二：用计算的方法在大规模表达数据里筛选非编码RNA。非编码RNA在细胞过程中起着重要的作用，如DNA的复制、RNA的转录加工、蛋白的输运和降解。果蝇的神经系统相对于脊椎动物等其它物种来说相对简单，但是它的神经系统又具有一定的特殊性和代表性，例如果蝇可以完成觅食、交配、求偶、学习记忆以及昼夜节律等复杂行为。本文在大规模的表达数据里筛选出在果蝇大脑里特异表达的非编码RNA，研究这些非编码RNA对果蝇行为认知的影响；第三：在我们实验室建立的线虫C.elegans的非编码RNA文库的基础上，用生物信息学的办法发现了三个非编码RNA上游的motif序列，本文在线虫的胚胎里建立体外转录系统来研究非编码RNA特异的转录调控。