基于L-赖氨酸骨架的APN抑制剂的计算机辅助设计、合成及活性研究

来源 :山东大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:usa8577037
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:氨肽酶N(Aminopeptidase N,APN),也被称为CD13,是一类锌离子依赖性金属蛋白酶,广泛存在于小肠、肾及中枢神经系统的多种细胞表面。与正常细胞相比,该酶在肿瘤细胞表面高水平表达。研究发现,APN在肿瘤生长、侵袭和转移过程中发挥着重要作用。例如,APN可降解细胞外基质,促进原发肿瘤的生长侵袭,有利于肿瘤的转移;同时APN还可以促进肿瘤新生血管的形成,是肿瘤新生血管的调节器;另外该酶还能够降解胸腺肽和白介素,从而降低机体免疫机能。正因为APN与肿瘤的密切关系,APN抑制剂的研究已经成为抗肿瘤研究领域的一个热点。Bestatin作为第一个上市的APN抑制剂,临床上主要用于治疗急性成人非淋巴性白血病。近年又发现许多天然APN抑制剂,如Probestatin,Amastatin,Curcumin等;另外,人们还合成了许多小分子化合物APN抑制剂,如α-氨基磷酸抑制剂,β-氨基硫醇类抑制剂等。本课题组以APN为靶点,经十几年的研究亦报道了许多小分子类肽化合物。本研究以APN为靶点,在充分调研文献的基础上,通过计算机辅助药物设计技术,设计、合成一系列以L-赖氨酸为基本骨架的小分子化合物,并对它们进行初步的活性筛选,以期发现具有较好的APN抑制活性的先导化合物。方法:由APN的晶体结构及抑制剂与酶的作用模式可以看出与APN活性位点相对应,对应的APN抑制剂应由三个部分组成:A疏水性芳环侧链;B锌离子螯合基团位于中间连接片段上;C疏水性芳环侧链。A和C两个疏水侧链经B部分相连。本研究利用已知的APN抑制剂建立合理的APN受体评价模型,通过常见的锌离子螯合基团,采用SYBYL/Unity模块从NCI2000化合物库中挑选出具有锌离子螯合基团的化合物。而后将这些化合物与所建立的APN受体评价模型进行对接,挑选出打分较高的化合物作为中靶化合物。在此过程中,库中原有的APN抑制剂Bestatin(ID:265489)、Phebestin(ID:702307)、para-hydroxybestatin(ID:327461)作为测试分子以验证方法的有效性。参考中靶化合物和一些已知的APN抑制剂,进而设计了一系列结构全新的以L-赖氨酸为骨架的目标化合物。本研究将目标化合物进行了体外抑酶实验、体外肿瘤细胞(HL-60,ES-2,K562,A549,H7402,PLC)生长抑制以及体内抗肿瘤转移实验,从中筛选出具有APN抑制活性的抗癌先导化合物。结果:本文共设计并合成了44个目标化合物,并对所有化合物通过红外光谱、核磁共振氢谱、电喷雾质谱等方法进行了结构确证。经查阅文献证实,所合成的目标化合物为新型化合物,未见文献报道。在C系列化合物中,化合物C7的抑酶活性优于两个阳性对照药B6和Bestatin,化合物C20的抑酶活性与它们相近。在D系列化合物中,化合物D9、D15的抑酶活性优于两个阳性对照药B6和Bestatin,化合物D24的抑酶活性与二者相近。MTT法体外细胞实验测定了目标化合物对HL-60人白血病细胞株、ES-2卵巢透明癌细胞株、K562人白血病细胞株、A549人肺腺癌细胞株、H7402人肝癌细胞株及PLC人肝癌细胞株的生长抑制作用,结果显示对APN酶抑制作用较强的化合物C7、D9、D14、D15、D23同样有很强的HL-60细胞抑制活性,超过了阳性对照药Bestatin;化合物D14、D21的ES-2细胞抑制活性优于阳性对照,D23与之相当;化合物D21的H7402细胞抑制活性优于阳性对照,C7、D24与之相当;化合物C7、C20、D9、D14、D15、D19、D21、D23、D24的PLC细胞抑制活性均优于阳性对照。本文在虚拟筛选的基础上,以所设计、合成的化合物为对象,利用计算机软件进行了初步的定量构效关系总结。采用比较分子场分析方法(CoMFA)建立了L-赖氨酸类APN抑制剂的定量构效关系(QSAR)模型。通过对CoMFA模型立体场等势线图和静电场等势线图的分析,建立的COMFA模型具有较高的交叉验证系数q~2和一定的预测能力。最后,我们还得到一个化合物D24与突变嗜酸热源菌三角交互作用因子F3的共结晶复合物。结论:本研究基于APN的晶体结构及抑制剂与酶的作用模式,利用计算机软件进行设计、合成的L-赖氨酸类化合物具有很好的APN抑制活性。所设计的合成路线科学合理,原料经济易得。通过初步的活性测试发现了具有进一步研究价值的抗癌先导化合物。其中,化合物C7、D9、D15的抑酶活性优于阳性对照药Bestatin,可作为先导化合物用于指导下一轮的结构优化。此外,我们基于化合物结构和活性数据建立了有一定预测能力的定量构效关系模型,为今后新型氨肽酶抑制剂的研究奠定了基础。
其他文献
入境旅游的时空变化及影响因素与客源地和目的地之间相互联系有关。基于2014-2017年江苏省入境旅游14个主要客源地每月游客量数据,根据极差标准化以及季节强度指数等方法分析
"桥路通全国,资源融世界。"国家强盛离不开交通,一条条道路成为地区发展的动脉,激发了无限的经济活力。安徽省是我国东南沿海地区与内陆腹地的过渡带,也是沟通京、沪、宁的南北
简述了哈斯效应和梳状滤波效应及其对主观听音的影响,然后对厅堂和听音室早期反射声的作用及控制进行说明,重点说明了厅堂最佳侧向反射声和听音室或控制室最佳初始延时,最后
水头是我国乃至世界石材行业的原料、加工、批发和成品主要集散地。水头石材商非常注重广告,广告可以帮助经销商提高知名度和获得直接的客户。石材由于其天然颜色和纹理的千
本文针对光学色度实验的开设,就反射光色度实验提出了新的实验方案,并给出了依据此方案所获得的实验数据及分析结果。
新亚欧大陆桥沿线城市领导联谊活动,由连云港、西安、博州等城市联合发起,沿桥部分城市政府参加,旨在促进新亚欧大陆桥沿线城市和地区在经贸、文化、旅游等领域的交流与合作.实现
教材解读一直是教师工作的重要内容,它关系到教师的课程设计、课程组织与实施;更关系到教学目标的实现、教育目标的达成.解读教材在当今具有重要的意义.然而,如何正确把握小