鉴定小鼠炎症性大肠癌模型中结肠炎向大肠癌演进的基因表达变化

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目的:虽然炎症与大肠癌的致病过程一直存在密切联系,但是其潜在的分子机制有待进一步阐明。化学诱导结肠炎相关大肠癌模型是一个研究“炎症-癌症”联系、寻找新的潜在临床诊断标志的经典动物模型。高通量检测技术可用于与人类疾病具有相似分子过程的动物模型研究,为证实AOM/DSS模型的基因表达谱变化能否同时体现人类疾病所观察的现象;我们通过应用基因表达谱芯片来筛选小鼠结肠炎相关性结肠癌(CAC)的新候选基因、进而揭示人CAC特异的基因表达模式及CAC发生机制。  方法:本研究采用化学诱导法联合或单独应用AOM(致癌剂)腹腔注射与DSS(致结肠炎药物)饮用,经病理组织学证实:在第100天成功建立了BABL/C小鼠炎症性大肠癌模型。继而对结肠炎模型组(DSS组),结肠炎-癌症模型组(AOM/DSS组)和对照组(K组)共三组,每组3例,进行全基因组表达谱芯片检测;并通过实时荧光定量PCR验证芯片数据的可靠性与有效性。  结果:  (1)造模100天时,在D组和AD组中结肠的长度发生明显缩短,而A组的结肠长度未见明显变化。在D组和AD组中,有超过50%的小鼠出现轻度腹泻,未见肉眼血便;而且,AD组中有超过50%的小鼠同时伴有脱肛。病理组织学评估:在AD组中80%小鼠其远端肠壁可见恶性菜花样增生灶,其他三组并没有检测到。镜下观察到AD组小鼠远端肠粘膜呈现典型的腺癌征象,很少伴有粘膜下浸润,无远处转移;A组可见肠粘膜腺样增生、散在的中-重度不典型增生灶;D组小鼠结肠以炎症和炎症恢复期的表现为主。即造模第100天,小鼠CAC模型成功建立。  (2)应用全基因组芯片检测,在D,AD和K三组中共筛选出6301个差异表达基因,其中包括93个持续上调和139个持续下调基因(D vs K→AD vs D→ADvs K)。通过GO注释和KEGG通路富集分析发现:这些持续差异表达的基因主要富集在代谢通路或者肿瘤微环境的炎症成分通路中。为了筛选出可作为炎症到癌症转换的标志,利用小鼠蛋白-蛋白互作(PPI)网络进行了进一步分析:找到了2个与差异表达基因互作的蛋白或酶类,它们主要参与细胞周期、DNA复制、细胞分化、细胞极性和运输的调节。  (3)同时,本研究选择了12个重要候选基因(包括6个持续上调,3个持续下调基因和3个潜在差异表达基因)进行real-time PCR检测,发现其结果与芯片数据一致,验证了芯片检测的有效性和可靠性。  结论:本研究成功建立了AOM/DSS化学诱导的小鼠CAC模型,并通过高通量基因表达谱分析,鉴定了5个代谢相关的基因和7个重要的新基因,它们在结肠炎相关的CRC中的表达存在显著的、持续的差异(D vs K→AD vs D→ADvs K)。通过实时荧光定量PCR进一步验证了芯片数据的有效性和可靠性。这些基因在小鼠结肠炎-结肠癌演进过程中,富集在Wnt信号通路转导、细胞因子-细胞因子受体相互作用、代谢和肿瘤微环境通路中。因而,提示肿瘤代谢的调节和肿瘤微环境通路,可能在炎症加速的CRC中发挥重要作用。为了筛选可作为炎症到癌症转换的标志,本研究利用蛋白互作(PPI)网络进一步分析:找到了2个与差异表达基因互作的蛋白或酶类,它们主要参与细胞周期、DNA复制的调节。进而揭示:细胞周期、DNA复制的调节紊乱可能加速炎症促癌的进程。本研究通过利用全基因组表达谱分析和相关的生物信息学方法,发现CAC与代谢、肿瘤微环境中的炎症成分之间的密切联系。
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