在2005年股权分值改革之前，我国上市公司存在大量募集资金滥用，利用再融资侵占投资者利益的现象。2006年5月8日，随着中国证券市场股权分置改革取得了阶段性成果，市场融资功能(包括再融资)得以恢复，并且增发取代配股成为上市公司主要的再融资手段。在全流通背景下，大股东和中小投资者利益趋于一致，且监管体系日趋完善，过去的部分利益侵占现象得以抑制。但上市公司控制人利用股份优势、资金优势和信息优势，在上市公司实施增发的过程中屡屡出现的高频率、巨额公开增发、低价向关联方定向增发、以及伴随增发过程产生虚假信息和内幕交易等，依旧引起了广泛而巨大的争议。而上市公司增发是否是为了“圈钱”，是否侵害了中小投资者利益，是否损害了中国资本市场健康发展等问题也成为了资本市场的焦点问题。　　 本文首先定义了增发利益侵占的含义，并对全流通之后上市公司增发相关数据进行了统计描述，对比分析公开增发、针对6类机构投资者的定向增发与针对大股东和关联方的定向增发三类增发形式在增发时机选择、增发前后业绩对比、增发前后股价走势等因素的显著差异，根据其业绩股价走势和利益侵占的模式将增发划分为对外增发和对内增发两种类型。并对目前资本市场上存在的增发利益侵占的动机与手法做了初步的总结与分析。　　 接下来本文构建了一个理论模型，综合分析了增发过程中的投资者利益侵占问题。模型首先考察了在上市公司增发过程中大股东和管理层与投资者利益不一致的根源与相应的侵占动机，接下来分析了上市公司控制人利益侵占的环境和条件，最后通过多阶段博弈分析研析增发过程中上市公司控制人对中小投资者的利益侵占的手段和结果，以及监管对对利益侵占的遏制和对投资者的保护作用。　　 在实证研究部分，有别于目前大多数相关文献注重对再融资利益侵占程度的宏观比较和对利益侵占上市公司静态特征进行研究的思路，本文从增发公司利益侵占行为的动态特征角度出发，根据侵占组上市公司在增发过程中进行的利益侵占行为所表现出的数据特征建立相关的实证分析模型。本文在综合考虑“行为论”和“结果论”的基础上，根据上市公司增发相关数据区别具有侵占行为的增发公司和正常融资的增发公司，并对二者情况进行对比分析。之后本文考察了“侵占组”增发公司的初步特征，分析了目前传统的判别分析方法在识别“侵占组”增发公司过程中的局限性，介绍了本文通过盈余管理和股价操纵相关信息判别侵占公司的研究思路。之后本文通过修正琼斯方法与股价操纵实证模型证明了“侵占组”公司在增发过程中存在显著的盈余管理与股价操纵行为；接下来运用Logistic计量模型和事件研究法详细分析了“侵占组”上市公司在增发过程中进行盈余管理的具体操纵手法与相关会计科目，以及在股价操纵过程中的超额收益、流动性和信息披露的异常现象。　　 本文的一个重要结论是结合前文的实证分析结果和风险管理理论，利用因子分析方法得出了反映“侵占组”增发公司的主要信息指标，并在此基础上构建了上市公司增发利益侵占的probit和logit预警模型。该模型可以帮助投资者和监管层在上市公司增发前有效识别侵占概率较大的公司，并采取相关的预防和调查措施。　　 本文还对目前规范上市公司增发行为、保护投资者利益的相关法律法规进行了评述，从增发利益侵占的事前预防、事中控制和事后追偿角度提出了改进管理办法、完善法律法规的政策建议。