酵母双杂交文库构建与TMEFF2相互作用蛋白筛选

来源 :同济大学医学院 同济大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xingxing7978
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TMEFF2(transmembrane protein with EGF-like and two follistatin-like domains)基因是近年来新发现的一类与神经发育相关的基因,目前对其功能研究还较少。本实验室通过构建单侧视网膜摘除的鸽模型,用消减抑制杂交法建立了鸽左前脑的cDNA差异表达文库,并且通过反Northern杂交筛选出一些差异表达的EST片段。我们从中选取了一条EST片段,通过RACE法成功的克隆了其全长基因,且经同源性比较证实为TMEFF2基因。为了探究TMEFF2基因的功能,我们将其EGF样功能域作为酵母双杂交的“诱饵”,对正常人脑cDNA文库进行筛选,经DNA序列测定证实为Celsr2、G3BP2、agrin、prosaposin等,因此初步确定TMEFF2基因与神经发育及信号转导相关。 为了更进一步探究TMEFF2的功能和作用机理,本文首先构建了TMEFF2基因胞内域的酵母双杂交“诱饵”表达载体,经验证无自激活现象并且对酵母菌株无明显毒性,western印迹对蛋白表达的定性分析显示目的蛋白表达正确;其次利用酵母体内能够发生高频率同源重组的特点,采用CLONTECH SMART(Switching Mechanism at5end of RNA Transcript)技术,以人脑总RNA为模板,通过逆转录和长距离PCR构建了酵母双杂交cDNA文库;最后以CLONTECH MATCHMAKER SYSTEM3为操作平台,利用融合的方法对自行构建的人脑cDNA文库进行筛选,最终得到一个与人ryanodine receptor2(RYR2)同源的基因和一个未知基因(Homo sapiens mRNA;cDNA DKF2p686C06106),由此推测TMEFF2基因胞内域中潜在的G蛋白激活模序可能与Ca2+或者酪氨酸蛋白激酶介导的信号转导通路相关。 此外,在克隆TMEFF2基因全长cDNA的过程中,我们还意外地发现了一个新的TMEFF2剪接体序列。序列测定和分析表明,该剪接体缺失的长度为60bp的序列恰好构成TMEFF2基因的第7个外显子,由此推测该剪接体可能是在大脑mRNA的选择性剪接过程中形成的。有关该剪接体的功能及其在同一个体中所占的比例和在人群中的分布频率,尚有待进一步实验的证实。
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