角毛壳菌（Chaetomium cupreum Ames）是一种重要的生物防治真菌，对多种植物病原真菌均有很好的防治作用。本文以角毛壳菌（C.cupreum）为研究对象，应用cDNA文库构建、表达序列标签测定（ESTs）、生物信息学分析和转基因技术，研究角毛壳菌（C.cupreum）的生物防治分子机理，为研究和开发新型角毛壳菌（C.cupreum）微生物杀菌剂奠定坚实的基础。　　利用分别以葡萄糖和几丁质为碳源生长的角毛壳菌（C.cupreum）菌丝体为材料，成功地构建了角毛壳菌（C.cupreum）两个不同培养条件下的cDNA文库，分别命名为菌丝体cDNA文库（简称C1文库）和菌丝体诱导cDNA文库（简称C2文库）。C1文库的滴度为0.93×106pfu/mL，重组率为94.2％，插入片断平均长度约1.3kb。C2文库滴度为1.02×106pfu/mL，重组率为95.3%，插入片断平均长度约1.2kb。　　对随机挑选的cDNA克隆进行ESTs测定和生物信息学分析，C1文库共获得3069条高质量ESTs序列，它们代表了1471条单一基因（unigenes），包括392条重叠群（contigs）和1079条单拷贝基因（singlets）。其中874条单一基因与国际公共非冗余蛋白质数据库蛋白同源，代表已知功能基因，597条为未知功能的新基因。GO分类表明已知基因中与生物学过程（61.75%）相关的功能基因最多，其次是分子生物学功能基因（33.65%）和细胞组分（4.60%）功能基因。　　C2文库共获得1221条ESTs序列，拼接为828条单一基因，包括176条重叠群，652条单拷贝基因；468条为已知功能基因，360条为未知功能新基因。已知基因中也是与生物学过程相关的功能基因所占比例最高（63.31%），其次是分子生物学功能基因（33.77%）和细胞组分功能基因（2.92%）。C1和C2文库所获得的ESTs序列登录在国际GenBank数据库中，序列接受号为DV544375-DV548659。　　对C1和C2文库进行了基因表达差异分析。在两个文库中共同表达的基因是333条，C1文库中特异表达基因是1138条，C2文库中特异表达基因是495条，其中包括11条与生物防治相关的基因。　　对C1和C2文库进行了代谢途径差异分析。共发现角毛壳菌（C.cupreum）70种代谢途径，其中C1文库中包括67种代谢，C2文库中包括63种代谢。分析表明，角毛壳菌（C.cupreum）在与植物病原真菌斗争过程中，通过启动糖异生作用等代谢来提高自身的生长速度，以争取更多的营养和生存空间与植物病原真菌竞争。　　C1文库中得到20条与生物防治相关的基因，C2文库中得到23条与生物防治相关的基因，研究发现，角毛壳菌（C.cupreum）的生物防治作用是多机制协同作用的复杂体系，主要涉及细胞壁降解作用、蛋白酶水解作用、拮抗作用等。　　两个文库获得的生物防治基因不同。C2文库中独有的与生物防治相关表达基因主要是PTR2转运蛋白（DV547977）、β-N-乙酰葡糖胺糖苷酶（DV545166）、α-葡萄糖苷酶（DV548040）、ABC转运蛋白（DV546007）。　　克隆了角毛壳菌（C.cupreum）46kDa内切几丁质酶基因（Chi46，序列登录号EUI42805），利用构建的pYES2-Chi46酵母表达载体，将Chi46基因成功转化到酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）H158菌株。对转化子发酵条件进行优化，结果表明：当半乳糖诱导浓度为2.5%、几丁质浓度为0.4%、诱导培养基的起始pH值为6时，可较大幅度地提高转化子几丁质酶酶活，最高可达1.96U。