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YN87448病毒是中国于1986年首次从云南发热病人血清中分离到的甲病毒,对YN87448病毒进行研究,可以从病原学角度证实该病毒与疾病的关系.他们创立了一个新方法--单引物差异RT-PCR显示方法.克隆到了YN87448毒株的基因片段.该法从甲病毒结构蛋白E1区氨基酸保守序列"MWG"对应的基因序列入手,只设计一条特定反向引物5-CGC TCG AGC GCC CCA CAT-3,用该引物既做反转录,又做超低温(35℃)退火的聚合酶链式反应扩增(PCR).再借助对照实验排除非特异的扩增,经2%琼脂糖凝胶电泳分析找到一条长为1.1K的病毒特异扩增条带.经克隆后测序.结果表明:该片段长为1118个核苷酸,经与基因库同源序列比较得知:它与辛德毕斯样病毒(Sindbis-like virus)S.A.AR86株相应基因的核苷酸序列同源性为98%.鉴定该病毒为辛德毕斯样病毒.在这以后,我们再用免疫抗体捕获RT-PCR法,及Martin Pfeffer建立的鉴定甲病毒基因序列简并引物法,对YN87448毒株进行分子生物学的再鉴定,结果表明:免疫抗体捕获RT-PCR法扩增出的病毒特异片段长为321个核苷酸,Martin Pfeffer的简并引物RT-PCR法扩增出的病毒特异片段长为1376个核苷酸,这两段核苷酸序列均与辛德毕斯样病毒S.A.AR86株相应基因同源性为98%.这进一步证实:用他们创立的单引物差异RT-PCR显示方法,鉴定甲病毒YN87448是辛德毕斯样病毒结论是完全正确的.然后参照辛德毕斯病毒家族基因序列的共同保守区,设计引物.对YN87448毒株的全基因序列进行了测定,再应用CLUSTAL W(Version1.6)软件对病毒基因组同源性与病毒进化关系进行分析.