热休克蛋白90α(Hsp90α，heatshockprotein90α)作为分子伴侣能够与多种客户蛋白相互作用，帮助客户蛋白折叠、成熟、稳定和发挥功能。这些客户蛋白大多在肿瘤细胞中发生过表达或突变，在肿瘤的生长和维持阶段起着关键的作用。Hsp90α通过维持其客户蛋白的稳定和活性，间接调控细胞内的信号转导通路、细胞周期调控和凋亡，Hsp90α独特的性质使其成为抗肿瘤治疗的良好靶点。Hsp90α的N末端结构域(Hsp90N)包含一个高度保守的ATP结合口袋，是Hsp90α抑制剂的结合位点，自从格尔德霉素和赤根霉素被发现能够通过结合到该口袋，达到抑制Hsp90α的功能的效果，Hsp90α作为抗癌药物靶标引起了人们极大的兴趣。　　 基于片段的药物发现(FBDD)方法是一种较新的先导化合物发现方法，已有关于应用该方法发现的先导化合物甚至候选化合物的报道。本实验结合FBDD方法，对片段小分子库进行虚拟筛选，得到了可能对Hsp90α具有抑制能力的片段分子，并结合蛋白质晶体学的方法，对虚拟筛选结果进行了进一步的筛选和验证，发现了一系列分子量小、相对结合效率高的片段化合物。通过Hsp90N-抑制剂复合物结构分析，与蛋白质有相互作用的片段小分子被有效优化改造成为潜在的Hsp90抑制剂。本论文主要以筛选得到的片段化合物FJ1为例，通过Hsp90N-FJ1复合物的晶体结构，分析了蛋白与小分子间的相互作用以及二者的结合方式，并通过荧光偏振(FP)实验证明了化合物FJ1对Hsp90α有抑制能力。　　 RecJ蛋白是一类在细菌和古菌中高度保守的蛋白，在细胞内参与同源重组、甲基定向的碱基错配修复和碱基切除修复等过程。RecJ蛋白不仅能够从DNA的5端降解单链DNA，还能够从RNA的3端降解单链RNA。为了能够从结构上阐明古菌火球菌(P.furiosus)RecJ蛋白在细胞内的功能和其对不同底物(RNA/DNA)的降解活性差异，本实验采用蛋白质晶体学的方法，详细介绍了火球菌RecJ蛋白质粒的构建、转化和RecJ蛋白的表达、纯化、结晶条件的筛选及晶体X-ray衍射，并对衍射数据进行了初步处理，确定了该晶体属于三方晶系，晶胞参数为:a=b=132.91(A)，c=501.68(A)，α=β=90°，γ=120°。由于c方向的晶胞参数太大且晶体的衍射分辨率还达不到结构解析的要求，空间群无法具体确定，可能为P6122或者P6522。