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为了达到苹果高产和高品质的目标，矮化砧木的应用及矮化密植栽培已成为现代化苹果生产的发展趋势，选育适应性强的矮化或半矮化砧木是苹果育种的重要目标之一。目前对于砧木导致苹果树体矮化的机制不清、评价砧木矮化性能的指标不统一，尚不能对苹果杂种实生后代进行有效的矮化预选，使得矮化砧木的选育周期长。本试验以苹果优良矮化砧木(MAC<,9>、CG<,24>、CX<,3>、扎矮76)、半矮化砧木(SH<,29>、SH<,28>、CX<,4>)和乔化砧木海棠为试材，通过测定新梢生长量、枝皮率、叶片栅海比、POD酶活性、PPO酶活性、总酚含量、内源激素等，筛选出评价苹果砧木矮化性的适宜参数指标；并对4个柱型苹果杂种实生苗的优选株系2号(舞美种子自然实生后代)、4号(“舞美×舞乐”杂交后代)、8号(舞美自交后代)和15号(“舞美×海棠”杂交后代)的砧木矮化性作出早期预选，以期缩短苹果矮化砧木的筛选年限。试验结果表明：
1．不同类型矮化砧木的年均新梢生长量在14.55cm至24.53cm，显著低于半矮化砧木(在28.80cm至31.75cm)和乔化砧木海棠的新梢生长量(42.21cm)，能有效的反映砧木的矮化性，可以作为苹果砧木矮化筛选指标；
2．砧木的枝皮率变化范围在矮化类型中为 35.87～42.54、在半矮化砧木类型中为 34.85～42.65、乔化砧木29.19。乔化砧木的枝皮率显著低于矮化及半矮化砧木，但矮化与半矮化砧木的枝皮率差异不显著，仅可以作为苹果砧木矮化筛选的参考指标；
3．矮化砧木栅海比为1.25～1.26，显著高于半矮化砧木 (1.01～1.18)和乔化砧木 (0.72)，与砧木矮化性呈显著正相关，可以作为苹果砧木矮化筛选的指标；
4．矮化砧木和半矮化砧木春季新梢茎尖、叶片POD酶活性均显著高于乔化砧木，叶片POD酶活性与砧木的矮化性呈正相关，茎尖呈显著正相关，可以作为苹果砧木矮化筛选的指标；
5．矮化砧木春季新梢茎尖、叶片PPO酶活性显著高于半矮化砧木，与砧木的矮化性呈显著正相关；但矮化及半矮化砧木春、秋季新梢韧皮部PPO酶活性显著低于乔化砧木，与砧木的矮化性呈负相关，不适宜作为苹果砧木矮化筛选指标。
6．矮化砧木春、秋季新梢叶片总酚含量显著低于半矮化砧木，春季新梢叶片、韧皮部总酚含量与砧木的矮化性呈显著负相关；但春季新梢茎尖与砧木矮化性呈显著正相关，不适宜作为苹果砧木矮化筛选指标。
7．春季新梢叶片和春、秋季新梢韧皮部IAA、GA、ZR 和 ABA 含量各砧木间差异显著，但IAA含量与砧木的矮化性呈负相关，ABA含量则呈显著正相关，而ZR和GA 的含量与砧木的矮化无明显的相关性。比较各类型砧木中 IAA/ABA、GA/ABA和IAA+ZR+GA/ABA的激素比值，在矮化砧木、半矮化和乔化砧木中表现出显著差异；三个激素比值随着砧木矮化程度增强而下降，呈显著负相关。因此，砧木ABA的含量及IAA/ABA、GA/ABA和IAA+ZR+GA/ABA的比值可作为苹果砧木矮化性筛选的指标。
综合砧木矮化性筛选指标，筛选出与砧木矮化性显著相关的4个指标，即新梢生长量、春季新梢茎尖POD酶活性、秋季新梢韧皮部IAA/ABA、秋季新梢韧皮部IAA+ZR+GA/ABA。应用这几个参数指标对所有试材进行聚类分析。结果显示，乔化砧木组有海棠，半矮化砧木组有SH<,29>、SH<,28>、CX<,4>，矮化砧木组有CX<,3>、扎矮76、MAC<,9>、CG<,24>、4号，未知类型 1 (偏柱型)组有2号、15号，未知类型2(偏矮化)组有8号。此聚类结果与现生产上应用的各砧木的矮化性类型基本一致，说明其结果具有较高的准确性。以各砧木类型为中间砧进行田间嫁接试验，接穗为富士，基砧为海棠。结果表明中间砧木为矮化、半矮化砧木及待预选株系的嫁接苗株高和新梢生长量均显著低于乔化砧木，与初步的砧木矮化性预选结果相一致。