法人治理结构是企业所有权安排的具体化，是有关企业控制权和剩余索取权分配的一整套法律、文化和制度安排，这些安排决定了企业目标、行为，决定了企业利益相关者在什么状态下实施控制、如何控制、风险和收益如何分配等企业生存和发展的一系列重大问题。 随着农村经济体制改革的不断深入，农村信用社法人治理结构框架随之深化与完善，但与此并行的农村信用社法人治理结构运行异化现象也非常突出，在很大程度上影响了农村信用社改革成效和发展。 该文通过对我国农村信用社法人治理结构与发展历程的回顾评测，从垄断的存在以及退出机制缺乏、产权异化导致内部人控制、产权异化导致外部人控制、超经济权利的影响、信用风险管理无力、操作风险控制软化、经营短期化倾向突出等方面进行分析，探讨了这些问题的存在对我国农村信用社发展的影响，提出了应在因地制宜，选择不同的产权模式；构建完善的委托代理结构；完善资本授予制度，提高透明度，消除外部人控制；通过市场化改革改善经营机制激励等几个方面着手，完善我国农村信用社法人治理结构的政策建议。