人胚胎脑及肝脏中新非编码RNA的系统发现及功能研究

来源 :中国科学院研究生院 中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Hollan720
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“非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)”是一类不编码蛋白质的RNA分子。越来越多的研究发现:非编码RNA广泛存在于各种生物之中,几乎在所有生理和病理过程中发挥着重要的调控作用。   迄今为止,非编码RNA在人脑发育和进化中的研究还很少。本实验室采用一种可以高效富集中等长度(50-500nt)非编码RNA的克隆方法在人胚胎脑组织中发现了82个全新的转录产物。大多数新发现的非编码RNA在脊椎动物中不具有很高的保守性,有少数几个转录本仅仅在灵长类哺乳动物中存在。用Northern blot和基因表达谱芯片来探索这些新的非编码RNA的表达以及在胚胎脑不同发育时期的时间表达谱和胚胎发育中重要组织器官的空间表达谱,结果发现,某些非编码RNA(包括新发现的和已知的非编码RNA)在人脑发育不同时期的表达具有明显的差异,在不同的胚胎组织中也有很大的表达差异。本实验还用Northern blot检测新非编码RNA在3种脑肿瘤细胞系中的表达,发现有些非编码RNA在一种或两种肿瘤细胞中表达明显下调或缺失,通过将这些非编码RNA用瞬时转染的方法使其在神经母细胞瘤细胞系SH—SY5Y中过表达后,用MTS法测定细胞的增殖,发现其中一些非编码RNA能够明显抑制肿瘤细胞的增殖。综上,本研究结果提示非编码RNA可能在人脑发育以及脑肿瘤的形成过程中起重要作用。   运用同样的中等长度非编码RNA的富集方法,在人胚胎肝脏以及肝癌细胞系中用罗氏454高通量测序发现了700多个非编码转录本,用Northern blot验证了其中长度大于100nt的非编码转录本的表达,并用基因芯片在20对人肝细胞癌组织和癌旁组织中对这些非编码RNA进行了表达差异分析。
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