分子动力学模拟及自由能计算在环糊精水化及与磷脂分子包结作用中的应用研究

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本论文在已有实验和计算研究的基础上,应用最新的分子动力学模拟和自由能计算方法对环糊精常温液态水化过程及与磷脂分子相互作用这两方面进行了研究。 本文具体内容包括:用受控分子动力学(SMD)方法模拟了α-、β-和γ-环糊精在300K时从真空经过水溶液气液界面进入水相的动态水化过程。用自适应偏置力(ABF)方法计算了α-、β-、γ-以及2,6-二甲基化β-环糊精300K时从真空到水相迁移的自由能曲线,并且研究了它们在气液界面上的性质。用自适应偏置力方法计算了不同取向的α-、β-和2,6-二甲基化β-环糊精与磷脂分子DMPC头部沿着环糊精分子主轴相互作用的自由能曲线。
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