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胃癌是发病率及致死率极高的一种恶性肿瘤,影响全世界人群的健康。中国作为全球胃癌高发区之一,每年因胃癌所致的健康及经济负担极大。多数胃癌早期不易发现,严重影响胃癌病人的治疗及预后,给病人带来极大的生理及精神痛苦。因此,研究胃癌的易感性是十分必要的。单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)是一类重要的突变,很多基因的SNPs与胃癌易感性相关,可以作为胃癌易感性相关的生物标志物。炎症影响胃癌的发生、发展,而白细胞介素(白介素),是一类炎症相关的重要细胞因子。研究表明白介素(Interleukin,IL)基因的SNPs对胃癌的易感性也会产生影响。虽然已经发现多种ILs基因的SNPs与胃癌易感性相关,但现有的关于ILs基因SNPs与胃癌易感性的研究结果间仍存在争议。目的通过meta分析的方法找出与胃癌易感性有关的ILs基因单核苷酸多态性位点,并对筛选出的SNPs在河南省汉族人群样本中进行实验,验证其与胃癌易感性的关系,最后通过生物信息学等方法初步探索与胃癌易感性相关位点突变对生物学功能可能产生的影响。方法(1)基于meta分析的方法定量评价ILs基因SNPs与胃癌易感性之间的关系,找出与胃癌易感性相关的SNPs:使用NoteExpress软件整理检索后获得的以中国汉族人群为实验对象、研究内容为ILs基因SNPs与胃癌易感性关系的研究,通过Review Manager 5.3软件对符合纳入标准的研究进行meta分析,通过获得不同遗传模型下(共显性、显性、隐性、超显性模型)两者关系的比值比(Odds ratio,OR)及其对应置信区间(95%CI),找出四种模型下均与胃癌易感性相关的SNPs。(2)基因分型实验验证meta分析所得结果:在河南汉族人群中,对meta分析所得四种遗传模型下均与胃癌易感性相关的SNPs进行基因分型实验,检测是否与meta分析结果一致,并分析是否存在基因-环境交互作用。本研究依据病例-对照研究设计,对照组和病例组采用频数匹配的方式,对两组人群的性别及年龄(±2岁)进行匹配。样本量计算采用PASS 15.0软件,纳入胃癌病例和对照人群各660例。对meta分析结果确定的胃癌易感性相关SNPs,采用iMLDRTM多重SNP检测方法(Improved multiplex ligation detection reaction)在两组样本中进行基因分型实验。(3)对基因分型实验结果统计分析后得到的胃癌易感性相关SNPs,基于生物信息学,利用3dSNP以及VarCards在线分析网站,探索突变可能导致的生物学功能改变。(4)统计分析方法:基于SPSS 21.0软件,依据样本类型使用t检验或χ2验,分析病例及对照组间差异。拟合优度χ2检验用于检测各SNP在对照人群中是否满足Hardy-Weinberg平衡。不同SNPs与胃癌之间的易感性的关联分析基于logistic回归。PARP(Population attributable risk percentage)用于评价SNPs的公共卫生学意义。基因环境交互作用(SNPs与吸烟、饮酒等因素间)通过多因子降维法检验(MDR3.0软件)。结果(1)Meta分析所得不同遗传模型下与胃癌易感性有关的ILs基因及其SNP为:IL-1B基因rs1143627(隐性模型),IL-1B基因rs16944(共显性、显性、隐性模型),IL-6基因rs1800796(共显性模型),IL-8基因rs4073(共显性、显性、隐性模型),IL-10基因rs1800896(共显性、显性、隐性、超显性模型),IL-1 7F基因rs763780(共显性、显性、隐性、超显性模型)。四种遗传模型下关联分析差异有统计学意义的rs1800896及rs763780进行后续基因分型实验。(2)分型实验统计分析结果显示IL-17Frs763780与胃癌易感性密切相关:调整后的logistic回归分析显示,共显性模型中rs763780 CT基因型、显性模型中(CT+CC)基因型以及超显性模型中CT基因型也都提高了胃癌的患病风险(OR=1.41,.95%CI:1.08-1.86;OR=1.41,95%CI:1.08-1.84;OR=1.40,95%CI:1.07-1.84)。rs763780 CT基因型在年龄≥60岁组人群中(OR=1.59,95%CI:1.06-2.38)、男性人群中(OR=1.44,95%CI:1.05-1.98)、不吸烟者(OR-1.43,95%CI:1.01-2.02)、饮酒人群(OR=1.96,95%CI:1.19-3.25)及无胃癌家族史者(OR=1.41,95%CI:1.07-1.85)中均提示为危险因素;rs763780显性模型中的突变基因型(CT+CC),在年龄≥60岁组人群中(OR=1.54,95%CI:1.04-2.30)、男性人群中(OR=1.42,95%CI:1.04-1.94)、不吸烟者(OR=1.45,95%CI:1.03-2.04)、饮酒人群(OR=2.04,95%CI:1.24-3.35)及无胃癌家族史者(OR=1.40,95%CI:1.07-1.84)中均为危险因素,提示相应基因型携带者更有可能患胃癌。而IL-10 rs1800896实验结果经统计分析后显示其与胃癌易感性无关。(3)假阳性报告率分析结果显示,(CT/TT)或(CT+CC/TT)模型下,rs763780在全人群、年龄≥60岁、男性、非吸烟人群、饮酒者以及无胃癌家族史人群中的FPRP(False-positive report probability)值均小于预设值0.5,可以认为变异与胃癌易感性的关联有意义。(4)MDR分析基因-环境交互作用结果显示,具有吸烟、饮酒史且携带有rs763780 C等位基因的人群胃癌的发病风险,是不含有这三项的人群的2.37倍(OR=2.37,95%CI:1.86-3.01)。(5)利用在线分析网站3dSNP以及VarCards对rs763780所导致的生物功能的可能影响进行预测,结果显示:rs763780的变异在染色体层面对其相关联的基因间的相互关系产生影响,进而可能影响他们所调控的生物学功能,但对其所在基因编码的蛋白质功能等的影响程度较弱。结论(1)IL-17F rs763780(T>C)与胃癌易感性增加相关,而IL-10 rs1800896(T>C)暂未发现与胃癌易感性相关。(2)基因-环境交互作用分析结果显示,具有吸烟、饮酒史且携带有rs763780 C等位基因的人群胃癌的发病风险更高,即存在基因-环境交互作用。(3)rs763780的变异可能影响其在染色质环中相关基因间的相互作用关系,关于rs763780携带者胃癌易感性增加的具体生物学机制有待进一步研究。