外源性抗原蛋白被抗原提呈细胞(APC)摄取送入溶酶体中被降解为长度不一的肽段。在HLA-DM分子辅助下,MHCⅡ类分子相关恒定链多肽(CLIP)从MHCⅡ类分子的肽结合槽解离,使得外源性抗原降解的肽段进入MHCⅡ类分子空的肽结合槽中,形成稳定的抗原肽-MHC Ⅱ类分子复合物。之后再被提呈到APC细胞表面供CD4+Th细胞的TCR识别,激活Th细胞分泌细胞因子,促进CTL细胞特异性杀伤靶细胞或辅助B细胞产生抗体。Th细胞的活化对机体的细胞免疫和体液免疫功能都有重要的辅助作用。本文基于迭代自洽策略与支持向量回归机(ISC-SVR)方法建立了MHCⅡ类分子与外源性抗原肽结合亲合力预测模型,采用13mer扩展核心结合序列可以提高预测模型的性能,分别按照均值法、最大值法、结合法、加权平均值法4种方法计算MHCⅡ类分子与抗原肽的结合亲合力值。本文对17种MHCⅡ类分子配型进行了回归分析,与其他预测模型相比较,本文模型都得到了最佳AUC值。最后,以HLA DRB1*0101分子为例,分析讨论了MHCⅡ类分子与抗原肽的结合特异性。