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TriggerFactor(TF,由tig基因编码)是分子量约为48kD的蛋白质,由432个氨基酸残基组成,具有肽脯氨酰顺反异构酶(PPIase)活性和分子伴侣功能。它可与位于核糖体新生肽链出口处的L23/L29蛋白结合,是大肠杆菌中新生肽链所遇到的第一个分子伴侣,大约65-80%的新生肽链在TF的协助下折叠为正常构象的成熟蛋白质。TF分子可分为结构与功能相对独立的三个结构域:与核糖体结合的N端结构域(1-145)、具有肽脯氨酰顺反异构酶活性的M结构域(146-251)以及对TF发挥分子伴侣功能至关重要的C端结构域(252-432)。
在本研究中使用基于λ噬菌体的Red重组系统对野生型大肠杆菌BW25113菌株中的tig基因及dnaK/dnaJ基因进行了敲除,获得了Δtig、ΔdnaK/dnaJ、ΔtigΔdnaK/dnaJ等菌株。通过大肠杆菌表达谱芯片对这些菌株中的基因转录水平变化进行了研究,结果有助于了解triggerfactor及DnaK/DnaJ的作用底物及所影响的代谢途径。
在本研究中对原有的Red重组系统进行了改造,引入了负选择标记,使之除了基因敲除外还能够进行基因敲入。利用改造后的Red重组系统将编码TF的各结构域缺失突变体(M、NM、NC和MC)以及一个丧失了PPIase活性的点突变体(I195G)的基因敲入到tig基因的天然座位上,利用real-timePCR方法对所构建的这些突变体菌株中某些基因的转录进行了研究,结果表明triggerfactor在大肠杆菌体内的作用方式是复杂的,其各结构域可能作用于不同的底物。
构建携带triggerfactor突变体的ΔtigΔdnaK/dnaJ菌株,在不同温度进行培养。结果表明,triggerfactor在细菌体内主要是作为分子伴侣来发挥功能的,并且其N端结构域对于triggerfactor行使整体功能更为重要。