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目的：对新疆和田地区维吾尔族与阿勒泰地区哈萨克族两民族男性Y染色体的17个Y-STR基因座的遗传多态性进行研究，揭示其遗传多态性，获得各基因座的基因频率，了解各基因座在两民族中个体识别率的差异，对Yfiler试剂盒在法医学上的应用进行探讨；同时为新疆公安机关计算和田地区维吾尔族与阿勒泰地区哈萨克族群体17个Y-STR的单倍型频率与累积个体识别率提供基础数据资料；方法：分别选取96名维吾尔族和97名哈萨克族无关男性个体血样，Chelex法提取模板DNA，选用ABI公司AmpFISTR-YfilerTM试剂盒五色荧光复合扩增检验体系：一个反应管中可同步扩增17个Y-STR基因座；并用ABI3130XL遗传分析仪对扩增产物进行检测分析，使用Data Collection.3.0软件进行数据收集，GeneMapper ID v3.3软件进行分析，得到Y-STR的分型结果；结果：96例维吾尔族Y-STR基因座DYS456、DYS389Ⅰ、DYS458、DYS389Ⅱ、DYS390、DYS19、DYS385a/b、DYS392、DYS391、DYS439、DYS635、DYS393、Y-GATA.H4、DYS437、DYS438、DYS448各位点遗传多样性(GD值)分布在0.5300-0.9412之间；17个Y-STR位点共观察到单倍型95种，其单倍型多样性GD值为0.9998；97例哈萨克族Y-STR基因座各位点遗传多样性(GD值)分布在0.2769-0.8643之间；17个Y-STR位点共观察到单倍型95种，其单倍型多样性GD值为0.9996；结论：新疆和田地区维吾尔族17个Y-STR位点具有丰富的遗传多样性，选用ABI公司AmpFISTR-YfilerTM试剂盒，可为父权鉴定和父系进化研究提供有价值的遗传学资料；阿勒泰地区哈萨克族17个Y-STR基因座个别位点遗传多样性较差(GD值<0.5)，可以进一步扩大样本量来进一步验证YfilerTM试剂盒的17个Y-STR位点在该民族中的遗传多样性。