硫噻唑是一种有机化合物,化学名为4-甲基-5-（β-羟乙基）-噻唑。作为饲料添加剂生产原料之一,近年来随着国家环保意识的加强,对饲料香味添加剂生产厂可挥发性有机物排放量要求越来越严格,为解决硫噻唑生产进程中和使用过程中造成的环境污染,目前采用微生物处理方法进行降解是解决其对环境污染的方法之一。利用微生物的降解作用可以消除在生产过程中和使用过程中由于挥发性而溢出的该物质对环境造成的不良影响。本研究基于通过第二代高通量测序及宏基因组测序,筛选和挖掘出对硫噻唑有降解作用细菌及其功能基因。然后根据功能基因进行工程菌的构建。本研究通过高通量测序共检测到降解鱼腥香的环保设备中细菌群落有27门、37纲、72目、128科、207属。两个阶段采集的10个样品共产生888条OTU。其中环保设备水箱中第一阶段样品（YX1）包含的OTU数目为614,第二阶段样品（YX2）包含的OTU数目为765,共同拥有的OTU数目为491,YX1和YX2各自特有的OTU数目分别为123和274。经过两个阶段,环保设备水箱水体中细菌群落的多样性更加丰富,第二阶段比第一阶段增加了151条OTU,表明第二阶段比第一阶段有较多的特有细菌种类。YX1组样品的Chao1和ACE指数极显著（p<0.01）小于YX2组样品;YX1组样品的Simpson指数显著（p<0.05）小于YX2组样品;YX1组样品的Shannon指数极显著（p<0.001）小于YX2组样品。说明了YX2样品的细菌丰度和细菌群落多样性都高于YX1样品,随着生产进程的推移,环保设备水箱中细菌丰度和细菌群落结构多样性增加。通过对各细菌群落门和属水平分布分析,发现在门水平上优势菌种有十个,其中变形菌门（Proteobacteria,66.40%）、拟杆菌门（Bacteroidetes,9.42%）、放线菌门（Actinobacteria,3.15%）以及未鉴定细菌（Unidentified Bacteria,17.61%）的细菌总数占到各组样品的细菌总数的96%,为样本中最主要的优势菌。在属水平上优势菌种有三十个,其中短波单胞菌属（Brevundimonas,26.36%）、固氮螺菌属（Azospirillum,4.00%）、金黄杆菌属（Chryseobacterium,3.46%）及未鉴定细菌属（Uunidentified_Bacteria,17.22%）的细菌为主要优势菌,占样本细菌总数的51.04%。通过宏基因组测序,利用KEGG功能数据库找到关于硫噻唑的代谢通路图,其中一级代谢分为六类,包括了:细胞过程、环境信息处理、遗传信息处理、人类疾病、新陈代谢、生物体系统。在新陈代谢分类下,筛选到硫胺素代谢通路map00 780。在检测的细菌样本中,参与硫胺素代谢的酶一共有14个,其中由硫噻唑经羟乙基噻唑激酶（hydroxyethylthiazole kinase）的作用下,最终参与维生素B₁的合成。羟乙基噻唑激酶为thiM,经NCBI数据库中查找thiM基因序列,ID号为938 519,来源为Bacillus subtilis subsp.subtilis str.168菌属,功能基因片段为819 bp。利用质粒T-Vector pMD19为载体,转入E.coli DH5αCompetent Cells构建工程菌,通过Sanger法双向测序,得到正反两组碱基序列,将正反两条序列在EBI上进行基因序列比对,得到重合区间882 bp,其中与thiM基因片段819 bp完全重合。将构建的工程菌对硫噻唑在实验室条件下进行降解,测得对硫噻唑的平均降解率77.48%,枯草芽孢杆菌平均降解效率为62.83%。