哲罗鱼是我国的濒危物种，是一种大型冷水性鱼类，同时也是一种优良的淡水养殖种类。本研究利用分子标记技术研究了哲罗鱼生长性状及性别方面，主要包括以下内容：使用筛选出的多态性较好的22个微卫星分子标记分析了183尾人工养殖哲罗鱼（四个家系）的遗传多样性，共检测到67个等位基因，等位基因片段大小为109-452bp，平均观测等位基因数为3.0455，有效等位基因数为2.6522，平均观测杂合度和期望杂合度分别为0.5835和0.5640，22个位点中，有10个属于高度多态位点，11个属于中度多态位点，1个属于低度多态位点。　　 基于22个微卫星标记在4个家系的183尾哲罗鱼中扩增出的图谱，确定每个个体的基因型，利用CERVUS3.0软件进行亲权分析，计算候选父母的似然估计LOD值，LOD值最大者认为是真实父母，将4个家系区分开。在4对候选父母对的情况下，鉴定出了176尾哲罗鱼子代，混养群体的家系鉴定率为96.17％。实验测量了183尾哲罗鱼的体重、全长、体长、叉长、体高、体宽、头长、头高、头宽、吻长、口裂长、口裂宽、眼径、眼间距等14种生长性状，利用SPSS11.5软件进行生长性状与分子标记的相关性分析，获得12个与至少一种性状显著相关的标记，对这12个标记进行基因型间的多重比较，结果有17种基因型与至少一种性状呈正相关，12种基因型与至少一种性状呈负相关，这就为今后哲罗鱼的遗传育种工作提供了有效的分子标记。利用扩增片段长度多态性技术，分析比较了雌雄哲罗鱼之间的遗传差异。采用EcoRI/TaqI和EcoRI/Tru9I两个酶切组合，共45对引物组合对雌雄个体进行扩增，结果表明，电泳检测条带清晰丰富，两个酶切组合分别扩增出958和971个位点，多态性比例分别在4.76％～62.26％和6.98％～37.50％，研究结果未发现雌雄特异位点，但有15个位点在雌雄个体中的比例存在很大差异，使用这15个位点进行的聚类分析结果显示雌鱼聚在一起，雄鱼聚在一起。本研究积累了大量AFLP分析数据，可为哲罗鱼性别的进一步研究奠定基础。