毛白杨抗溃疡病相关基因的差异表达分析

来源 :东北林业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:w15002554773
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
杨树是林木中的模式树种,溃疡病是杨树的一种重要病害之一,在杨树的生长发育过程中,常常会受到多种病害和虫害的威胁,影响杨树的重要的经济价值。利用抗溃疡病的杨树品种是控制杨树溃疡病的最佳途径。由于对抗该病品种的抗病基因知之甚少,这样为应用抗溃疡病品种来控制溃疡病的发生,带来了巨大的困难。因此,随着分子生物学、遗传学、基因组学和生物信息学的飞速发展,给从分子水平上了解杨树抗溃疡病的抗病机理提供了坚实的技术基础,为了解抗溃疡病的基因表达及寻求新的抗病基因提够了理论基础和技术支持,对于获得稳定的、持久的抗溃疡病品种具有重要的理论与实践意义。  本研究运用抑制差减杂交(SSH)技术构建cDNA文库及EST技术,并结合生物信息学技术,对毛白杨抗溃疡病相关基因的表达进行分析,从转录水平来研究其抗病机制。以杨树抗溃疡病品种毛白杨(Populus tomentosa Carr)为实验材料,展开了对毛白杨抗溃疡病相关基因的表达研究,为今后杨树抗溃疡病的遗传育种等研究奠定了理论基础。主要内容包括:构建毛白杨被溃疡病菌侵染72 h后的SSH-cDNA库;从库中获得ESTs;将ESTs注释到Unisequences;挑选出毛白杨与溃疡病菌互作过程中上调的Unisequences;利用RT-qPCR对上调基因做进一步的分析。通过上述研究得到以下结论:  (1)本研究构建了毛白杨接种溃疡病菌72 h的SSH-cDNA文库,对杨树溃疡病相关基因差异表达进行研究。从597个阳性克隆中随机挑选199个进行测序,测序结果经与NCBI基因库中序列进行比较,172个EST找到了同源序列,并对这些EST在dbEST数据库进行同源检索分析,将其分为13个功能类,分别是信号转导(27.5%)、能量(14.8%)、未知功能(9.0%)、病程防御基因(16.4%)、蛋白合成(0.5%)、转录相关(5.3%)、运输(1.1%)、激素代谢(4.8%)、与辅因子结合(3.7%)、预测蛋白(10.6%)、抗菌肽(0.5%)、其它压力蛋白(1.6%)和与防御无关的EST(4.2%)。  (2)利用实时定量PCR(qRT-PCR),对14个防御相关基因(GAPDH、NADkinase、ATP synthase CFO A subunit、Digalactosyldiacylglycerol synthase2、CONSTANS-like protein、WRKY21、Kunitz trypsin inhibitor TI3(KTI3)、P450 like proteinprecursor、 Cysteine proteinase inhibitor、 Senescence-associated protein、 Actindepolymerizing factor7(ADF7)、Zinc finger protein(Cys/His-rich)、Beta-glucosidase(Bgl)和Calmodulin binding进行六个时间点(12h、24 h、48 h、72 h、96 h和144 h)的研究,结果表明,这14个EST序列在溃疡病菌侵染后不同时间段内基因表达量是变化的,是与抗病相关的基因。
其他文献
本研究以白马林场为研究区域,以2013年Landsat8OLI影像作为数据源,结合同期野外调查数据,利用遥感和GIS技术建立森林碳储量遥感反演模型,以期能有效地估测白马林场森林生物量
摘 要: 色彩静物写生训练,就是要培养学生的艺术观察能力、艺术表现能力。在静物写生中遵循色彩训练的要则,从而取得良好的训练效果。  关键词: 色彩静物 写生训练 观察能力培养  色彩训练往往从静物开始,这是因为室内光源稳定。室内写生采用的是由窗户照射进来的天光,不受变化迅速的日光直射,作画可以不受时间的制约,便于较长时间以至于持续数日地深入写生学习。静物比较能够任意选择与摆布,可以根据美学原则及构
摘 要: 本文对中职生现状和中职德育工作对策进行了探索研究,分析主题班会和班主任的说话艺术对德育工作起到的教学作用,希望为相关方面的研究提供理论参考。  关键词: 中职班主任 德育工作 主题班会 说话艺术  近几年国家大力发展中职教育,中职学校的发展受到社会的重视。中职学校要为社会输出一批有技术同时身心健康的技术人才。我们要求培养的技能人才,不仅技术过硬而且身心健康,所以中职德育工作必须加强。而班
该文以白云区为例,阐述了地理信息系统(GIS)在森林分类经营中的应用,目的在于掌握GIS和分类经营的基本理论、方法以及掌握用GIS来处理林业中的具体问题.森林分类经营将成为中
学位
“绘本教学”研究是教师在分析、利用绘本元素的基础上,让幼儿自主感知、操作、模仿和想象,并通过虚拟情境再现绘本场景,从而激发幼儿玩兴,并从中获取多方经验和能力的一种游
紫椴(Tilia amurensis)是中国东北林区珍贵的阔叶用材树种,人工造林后到闭前大的问题是相当一部分紫椴死亡.该文通过野外林分、林地的调查和实验室分析研究了霜冻、地形、植
精进业务,积极向优秀教师学习实践经验,形成自己的独特风格是广大教师的追求,但在这个过程中难免有真伪经验夹杂的问题、个性普适性的问题等。笔者就教学风格认识的误区谈谈自己的看法。  一、克隆一种教学风格  某些教师往往瞄准一位大家公认的名师,并认真学习他的教学风格,这种做法在取得短期效果后容易感到迷茫。因为单一照抄照搬的东西显得呆板僵化、毫无新意,自身的优势很难发挥,觉得很别扭,教学易失去活力,并且不
鉴于当前对PG与植物抗寒性之相关性的研究多集中于草本植物或亲缘关系较远的木本植物,该研究以亲缘关系较近,抗寒性差异大的多年生木本植物杨树及其杂种后代为材料,利用生理
为保证矿井提升机平稳起降,设计了一种基于模糊算法控制的环流变换器,目标是保证变换器电压输出波形为对称的正弦波.在具体的系统实现中,变换器主回路选择环流控制方式,采用