制药行业是医药制造业的主要组成部分，其中的生物制品行业是国家战略新型产业之一，将成为我国新的经济增长着力点，因此制药行业的发展不仅关系到我国医疗水平的提升，还关系到我国国民经济的发展和壮大。制药行业具有技术含量高、研发投入大、高风险和高回报并存的特点，行业资金需求大，融资效率的高低将显著影响制药行业的发展。本文通过三阶段DEA方法测算上市制药公司融资效率水平，发现制药公司整体融资效率较低。从第二阶段的环境因素回归结果来看，成立年份、老年人口抚养比和外商投资比例对融资效率的提升具有消极影响，而人均GDP的提升对融资效率具有积极作用。从化学药、中药和生物制品三个子行业来看，生物制品行业融资效率最低，原因之一是多数生物制品公司未能实现规模最优。从产权角度来看，国有和非国有上市制药公司融资效率差异不大，说明产权属性不会显著影响制药公司融资效率。接着通过tobit方法分析影响制药公司融资效率的内部影响因素，发现资金使用效率、盈利能力、成长能力和制药公司融资效率显著正相关，资本结构和融资效率显著负相关。以无形资产增长率表示的成长能力对生物制品行业融资效率影响系数更大也更显著，说明专利技术进步对技术要求更高的生物制品行业融资效率影响更明显。最后，本文基于实证研究结果，从政府和企业两个角度为提高制药公司融资水平提出建议。由于以无形资产增长率代表的成长能力与企业的融资效率正相关，建议政府鼓励研发创新，企业加强研发投入;由于资本结构和融资效率显著负相关，建议企业优化自身融资结构和融资期限;由于盈利能力和企业的融资效率呈正相关关系，建议完善财政补贴和税收优惠政策。