鹅SREBP-2基因的克隆及禽HLH转录因子的分类和进化分析

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SREBPs属于碱性螺旋-环-螺旋亮氨酸拉链(basic helix-loop-helix leucine-zipper,bHLH-zip)转录因子家族,是真核细胞内调节脂质合成的关键核转录因子。本研究测定了朗德鹅(Anser anser)与天府肉(Anser cygnoides)SREBP-2基因的部分mRNA序列,得到了bHLH-zip基序的氨基酸序列,以此为基础研究了生物体内HLH蛋自家族的特点和分类;以鸡的基因组为代表,研究了鸟类基因组内HLH转录因子的分类和进化。 序列提交到GenBank数据库中,登陆号为EF579754和EF579755。经比对,两品种鹅序列的相似性100%。 SREBP-2基因bHLH-zip基序在不同物种间保持高度的相似性,通过和其他物种的比较,发现发现5、14、23、25、28、32、54位点存在氨基酸多态位点。在和其它HLH转录因子比较时,发现鹅SREBP-2的bHLH-zip基序是一个不含脯氨酸(P)的HLH结构,这种现象还有待进一步研究。 利用鹅SREBP-2 bHLH-zip基序为基础,对HLH蛋白进行分类。结果在基因组中搜索到18种相关结构域,它们和HLH蛋白的功能密切相关,在进化中又保持了相对的独立性。这是基因组进化过程中存在的一种“结构域洗排”的机制。 以鸡的基因组为代表,研究了鸟类基因组中HLH转录因子的分类和进化。发现在鸡的基因组中,HLH转录因子包含28个蛋白家族,可以分为A、B、C、D、E五类。在进化上A和D接近,C和E比较接近,而A、C、D、E和B类的分歧时间早。同哺乳动物相比,鸡的基因组缺少F类,HLH转录因子的种类和数目也较少。
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