水稻响应砷胁迫的mRNA-Seq和miRNA-Seq研究

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水稻砷(Arsenic,As)污染是一个世界范围内普遍关注的食物安全问题,通过研究水稻对砷的积累机制将有望解决这一难题。利用芯片(microarray)技术已经鉴定出多种植物响应砷胁迫的基因,但是关于植物对砷响应的代谢通路以及调控网络的研究则进展缓慢。另外关于水稻对砷响应在miRNA层面上的调控也鲜见报道。   本研究利用Illumina高通量测序技术,从时间梯度和浓度梯度两个方面,在全基因组水平上对mRNA基因表达和miRNA调控水平进行研究,并进行对比分析。研究结果发现水稻根部受As(Ⅲ)胁迫的浓度梯度影响明显,而苗部受时间梯度影响显著。本研究鉴定到106个对As(Ⅲ)响应的转运蛋白,并且发现茉莉素等植物激素的合成和信号通路、腊质代谢通路的相关基因响应As(Ⅲ)胁迫,并且鉴定到468个转录因子在As(Ⅲ)胁迫下差异表达。同时我们在根部和苗部鉴定到36个响应As(Ⅲ)胁迫的miRNA,其中14个miRNA参与调控重金属转运、信号通路和脂质代谢通路。   本研究发现茉莉素合成和信号通路、脂质代谢通路的相关基因对植物响应As(Ⅲ)胁迫具有重要作用,同时从miRNA层面上对水稻应答As(Ⅲ)胁迫的调控作用进行分析。获得的结果对理解水稻响应As(Ⅲ)胁迫的转录调控机制具有重要的科学意义,在重金属分子毒理学和植物修复研究中具有潜在应用价值。
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