并购绩效一直以来就是上市公司研究的一个热点问题，国内外学者虽对其进行了大量的理论和实证研究，但至今未形成统一看法。与其他行业相比,我国医药行业近几年发展迅猛，尤其在中国加入WTO之后，我国医药企业面临国内外复杂激烈的市场竞争环境，并购活动频频发生，但并购效果如何，能否有效的改善医药并购公司的绩效，是否提升了上市公司业绩？为此本文从我国医药行业并购活动的绩效评价角度对并购绩效进行了补充研究。以期为我国医药上市公司并购的效果做出客观公正的判断，为上市公司的并购战略制定提供现实参考。　　 文章采用理论和实证相结合的研究方法，从总结分析并购理论入手，定义了并购和并购绩效，具体剖析了医药行业并购动因，并分析了我国医药行业的并购现状。在并购动因理论和协同效应等理论基础上，采用实证方法，以我国医药上市公司2002-2003年发生并购行为的并购方公司为研究对象，并以样本公司并购前后年度经营的财务指标为依据，根据因子分析原理，通过SPSS统计软件确定了5个主因子，构建了绩效综合得分模型，从样本总体、并购类型、并购动因三个角度对医药行业上市公司并购前后绩效进行了实证分析，并得出研究结论。　　 在实证研究基础上，为检验结论是否具有实践意义，进一步选取了2003年太极集团并购西南药业的案例。在考虑企业特征、事件背景等因素前提下，进行了客观、具体深入的并购绩效分析，印证了实证研究结论。通过点面结合的研究，得出了有现实意义的研究结果：我国医药上市公司并购方的总体绩效并购前后没有显著改善，但相对说来采取横向并购方式及以集团战略为并购动因的公司，取得了较显著的并购绩效。