本文探讨半翅目异翅亚目(Hemiptera-Heteroptera)的蝽次目(Pentatomomorpha)昆虫的分子系统发育。蝽次目昆虫是异翅亚目中最常见、最大的重要类群之一，世界性分布，全为陆生种类，多为植食性，有些种类是重要的农业害虫，具有重要的经济意义。本论文利用在昆虫分子系统发育中广泛使用的分子标记基因18SrDNA、线粒体COI基因和16SrDNA，分别和联合进行分析，对蝽次目昆虫的分子系统发育进行了研究。 　　本文以线粒体全基因组序列探讨节肢动物的系统发育。节肢动物种类繁多，具有漫长的进化历史，因而很难对这一古老类群进化早期的分化形式加以确定，这使节肢动物的起源成为系统动物学家长期争论的问题。目前，可利用的节肢动物线粒体基因组全序列越来越多，如何充分利用线粒体全基因组的遗传信息来重建节肢动物的系统发育变得极为重要。 本文通过GBDP法(genomeblastdistancephylogeny)，即利用BLASTN进行线粒体基因组的同源性搜索建立距离矩阵进而进行系统发育的分析，重建了节肢动物大多数类群的系统发育关系。