由博弈论与生物学结合产生的进化博弈论，做为一个有效的数学框架，在研究达尔文进化论中有关合作演化行为时起了很重要的作用。而随之，它也被拓展运用于解释自然界和社会科学各领域中出现的各种合作演化行为。 同时分子动力学方法作为一种计算机模拟方法，能够真实地模拟事物的运动轨迹，是对受限条件下的实验的有利补充，已被广泛运用到物理学、生物学等各种体系的模拟中。 在本篇论文中，我们把分子动力学与进化博弈论相结合，通过借用“囚徒困境”和“雪堆博弈”来研究毫无相关的个体之间的合作演化行为。结果表明，引入空间结构能有助于提高“囚徒困境”中的合作率，但对“雪堆博弈”却没有大的影响。同时，模拟结果显示，我们关于研究合作演化的模型是介于以传统规则网络与无标度网络为研究框架下的合作演化研究模型之间的一个过渡态模型。在模拟中，我们还引入“活泼因子”T*进一步模拟环境的变化，以便更接近真实的人群。