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ColR-ColS是在假单胞菌属中发现的一个典型的双组分系统，它的功能在4株不同的假单胞菌中差异显著。ColRS作为一个控制细菌根际定植能力的重要成分在Pseudomonas，fluorescensWCS365和PseudomonasputidaKT2440中得到了证实；在PseudomonasputidaPaW85中，ColRS在饥饿的条件下控制内生转座子Tn4652的转座频率；在PseudomonasputidaCD2中，我们又发现了ColRS的一个新功能，即控制金属离子的抗性，特别是锰离子的抗性。这些功能差异很大的ColR-ColS的同系物之间保持了非常高的同源性。为了能了解他们之间的联系，了解ColR-ColS的调控机制，找到ColR的下游基因非常必要。
本研究基于对原有实验结果的分析以及P.putidaKT2440的基因组分析，寻找受ColR调控的基因或基因簇。通过RT-PCR检测Znu系统和CzcCBA系统在PseudomonasputidaCD2野生型、重金属的诱导下的PseudomonasputidaCD2野生型、colS突变株PseudomonasputidaM11以及colR突变株PseudomonasputidaM12中的表达差异，确定受ColR调控的基因。RT-PCR结果显示，zurCB1、znuA1、znuACB2在不同菌株中的表达无差异。而czcCBA1的表达在Pseudomonasputida不同的菌株中差异显著，受重金属诱导后czcCBA1的表达量有大幅度的增长，而在colS突变株M11中未能检测到czcCBA1的表达，由此确定czcCBA1基因簇受ColR的调控。
本研究同时检测了ColR对下游基因的调控情况。通过分析在恶臭假单胞菌CD2、受重金属诱导的恶臭假单胞菌CD2以及突变株M11和M12中czcCBA1基因簇和oprQ基因启动子的表达，确定ColR对下游基因的调控机制。本研究通过分析新型报告基因GFP的表达量来检测报告基因上游启动子的表达情况。GFP表达量分析显示在重金属的诱导下，PczcCBA1的表达量是野生型的4.8倍，而PoprQ的表达量仅是野生型的0.06倍；在突变株M11中，PczcCBA1的表达受到了抑制，是野生型的0.6倍，而PoprQ的表达量却提高到野生型的1.27倍。该实验结果表明，ColR通过两种方式调控下游基因的表达。ColR作为一个正调控因子调控着czcCBA1基因簇的表达，而对于oprQ基因的表达来说，它又是一个负调控因子。
本研究通过RT-PCR以及启动子检测确定了ColR的下游基因czcCBA1和oprQ，并确定ColR对这两个基因的调控机制。ColR与czcCBA1的调控关系是目前还未报道的新发现，进一步的实验还在开展，希望得到更有价值的实验结果。