水稻是人类主要的粮食作物之一,全球有超过三分之一的人口都是以水稻作为主食。而持续增长的人口与日益减缩的耕地面积之间的矛盾正在日趋尖锐,如何提高单位面积的作物产量已经成为育种学家们最关心的问题之一。近年来随着分子标记的不断开发、遗传图谱的构建以及生物信息方法的发展,使得借助分子标记辅助育种,将产量性状相关的有利位点导入到优质品种中,达到快速、高效获得高产、优质新品种得以实现。筛选控制水稻产量相关的数量性状位点(quantitative trait loci,QTL),利用分子标记辅助育种来提高作物产量的方法已经成为国际上水稻育种项目的研究重点。桂朝2号是广东省农科院用朝阳早18和桂阳矮49杂交选育而成,具有高产、抗性佳等优势,是80年代水稻育种中重要的骨干亲本之一,但目前控制桂朝2号的高产性状的QTL并不明确。本课题以桂朝2号和桂阳矮49为亲本,通过单粒传代法构建重组自交系群体。分别考察了分离群体的株高、抽穗期、粒长、粒宽、千粒重、穗长、一次枝梗数、二次枝梗数、每穗总粒数共9个重要的产量相关农艺性状的表型数据,并利用酶切位点相关DNA测序技术(restriction site-associated DNA sequencing,RAD-Seq)检测群体的基因型,共开发了17783个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)分子标记,以SNP标记为基础构建bin框架图,共获得1688个bin标记,以此标记来构建遗传图谱,总图距为721.40cM,bin标记的平均遗传间距为0.43cM。结合群体的表型数据和基因型数据进行了QTL定位,共获得了29个控制水稻产量相关性状的QTLs,包括3个抽穗期QTLs,3个株高QTLs,5个粒长QTLs,6个粒宽QTLs,6个千粒重QTLs,1个穗长QTL,1个一次枝梗数QTL,5个二次枝梗数QTLs,3个每穗总粒数QTLs。与此同时,对桂朝2号、桂阳矮49和朝阳早18发育早期的幼穗早期进行了RNA-seq分析。这些研究为桂朝2号高产性状基因的精细定位和进一步解析桂朝2号高产性状的机理,以及未来借助分子标记辅助育种技术将这些QTL应用到水稻育种当中奠定了基础。