幽门螺杆菌dupA基因功能的研究

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目的:  DupA蛋白是近几年新发现的H.pylori毒力因子,由dupA基因编码。DupA蛋白可以升高十二指肠溃疡发病率,降低胃癌的发病风险,但该结论存在争议。目前国内外缺乏对dupA基因功能及其编码蛋白DupA致病机制的研究报道。  本文以H.pylori的dupA基因为研究对象,使用生物信息学、微生物学、免疫学和分子生物学等技术探讨dupA基因的功能及其编码蛋白DupA致病机制,为深入研究H.pylori的致病机制奠定基础。  方法:  1.采用PCR扩增的方法分离H.pylori WH-21菌株携带的dupA基因,获得目的基因片段并测序。使用生物信息学软件:ProtParam、ANTHEPROT5.0、SignalP4.1 server、PSORTb3.0.2对其基本的理化性质、信号肽和细胞定位进行预测分析;用NPSA_server在线软件预测分析DupA蛋白的二级结构;用Phyre2.0进行DupA蛋白三级结构配体的预测。  2.构建表达载体pET-32a-dupA,使用诱导剂(IPTG)在最佳条件下诱导表达融合蛋白;蛋白纯化后用Western blot法进行鉴定。  3.用纯化好的融合蛋白制备兔抗DupA多克隆抗体,酶联免疫吸附试验(enzyme-linked immunosorbent assay, ELISA)测定抗体效价。  4.利用同源重组原理,构建dupA基因缺失自杀质粒pBlueKM40-ΔdupA∷kan,电击转入感受态WH-21中,抗性筛选出阳性克隆,PCR验证,获得dupA基因缺失株。  5.收集并裂解WH-21细菌菌体,用超高速低温离心法获得不同的亚细胞组分,一抗使用上述制备的多克隆抗体,Western blot检测DupA蛋白亚细胞定位。  6.胃上皮细胞GES-1与dupA基因缺失株和野生株WH-21共培养,使用Western blot检测转运的CagA蛋白含量,研究dupA基因缺失对Ⅳ型分泌系统转运CagA蛋白的影响。  7.采用免疫共沉淀实验和质谱分析方法,进行DupA蛋白的互作蛋白分析。  结果:  1.H.pylori WH-21菌株dupA基因全长为2499bp,编码蛋白长度为832aa,相对分子质量为96.30kDa,等电点为8.46,属于稳定蛋白,亲水性强;存在多个跨膜区且没有信号肽存在;细胞定位预测提示DupA蛋白定位在胞膜;α螺旋是DupA蛋白多肽链中主要的组成结构元件;配体结合位点分析表明,DupA蛋白结合位点的物质为ADP、ATP和Mg2+并且与CagE_TrbE_VirB超家族有较高的同源性。  2.构建成功原核表达载体pET-32a-dupA,经过IPTG诱导及QIAGEN系统纯化后获得目的蛋白。  3.免疫家兔获得了兔抗DupA多克隆抗体,效价为1∶6.4×104。  4.构建成功dupA基因敲除重组自杀质粒pBlueKM40-ΔdupA∷kan。电转化自杀质粒进入H.pylori WH-21菌体内,通过卡那霉素抗性筛选及PCR验证得到H.pylori dupA基因缺失株即ΔdupA。  5.以兔抗DupA多克隆抗体为一抗作Western blot分析,确定DupA蛋白定位于胞膜。  6.H.pylori与GES-1做共培养,检测CagA蛋白转运量,结果显示dupA基因缺失株和野生株向胞内转运CagA蛋白无差别。  7.经过免疫共沉淀实验和质谱分析,DupA蛋白的互作蛋白为脲酶和HSP60。  结论:  1.成功克隆了dupA全长基因,并完成测序,使用生物信息学方法了解了其编码蛋白的基本特性,包括该蛋白一级结构、二级结构和三级结构特征及该蛋白细胞定位和功能结构域等。  2.成功构建了dupA基因的原核表达载体pET-32a-dupA,经诱导纯化获得目的蛋白,免疫家兔后获得兔抗DupA多克隆抗体。  3.成功构建了dupA基因敲除重组自杀质粒并通过筛选获得了一株dupA基因缺失株即AdupA。  4.DupA蛋白可能独立于CagPAI之外且存在于H.pylori胞膜,不参与CagA蛋白的转运,DupA蛋白与脲酶及HSP60存在互作关系。
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