产学研合作创新这种合作形式将以企业为主体的应用技术创新体系与以大学和科研机构为主体的理论创新体系有效的联系起来，推动技术创新与市场相融合，加速科技成果向生产力转化。产学研合作创新的突出优势是实现了资源的整合，而知识经济时代知识作为一种核心资源，实现产学研合作创新过程中的知识高效整合是实现产学研合作创新目标实现重要环节。因此，对于产学研合作创新知识整合进行研究具有十分重要的理论意义和实践意义。论文首先介绍了产学研合作创新知识整合的内涵、基本要素、目标和特征；然后，分析了产学研合作创新知识整合的过程，并借鉴生态学的理论分析产学研合作创新知识整合过程中的每个子过程机理，运用层级作用机理剖析了知识盘点过程，运用种群自我调节机理和种群竞合机理剖析了知识过滤过程，运用个体适应机理剖析了知识重编码过程，运用种群反馈机理知识重组过程。其次，针对产学研合作创新知识整合的特征、目标，分析了产学研合作创新知识整合的影响因素，并基于分析提出了相应的理论假设；再次，基于对产学研合作创新影响因素的分析设计了产学研合作创新知识整合影响因素调查问卷，运用结构方程和调查问卷收集的数据对产学研合作创新知识整合影响因素的相关假设进行验证和分析；最后，在分析产学研合作创新知识整合影响因素实证结果的基础上，提出了实现产学研合作创新知识整合的路径。