随着我国经济飞速发展,世界各国科技竞争激烈,推进大众创业、万众创新成为我国建成富强民主文明和谐的社会主义现代化创新型国家的关键。高等教育系统,尤其是研究型大学,在社会发展和科技进步过程中发挥着重要推动作用。科研经费是开展科学研究的物质基础,是科技创新的基本条件和重要保障。近年来我国教育事业加速发展与改革,我国高校承担的科研项目与筹措的科研经费呈现出大幅度增长趋势,科研经费成为学校重要的资金来源之一。为保障经费科学合理使用,各级科技主管部门通过制定经费管理政策规范科研经费的使用过程,进而影响着科学研究的活动。改革开放以来,我国各级科研经费管理部门相继出台了多项科研经费管理政策,给科研经费的规范使用提供了指导。但是政策本身及执行过程中,仍然存在许多不足,影响了政策效果的发挥,因此有必要对该主题进行深入的研究。本文运用文本分析等方法,对我国高校自改革开放以来执行的纵向课题科研经费管理政策进行分析,了解我国高校纵向课题科研经费管理政策的历史演变,解析我国高校纵向课题科研经费管理政策及其在执行过程中存在的问题及成因,例如预算编制不科学、预算执行不严谨、间接经费比例过低、人员绩效支出不足、信息平台不健全、监管政策不完善等。通过借鉴发达国家科研经费管理制度,对我国高校纵向课题科研经费管理政策的完善提供建议。