柑橘鳞皮病毒的RT-PCR检测技术研究

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柑桔鳞皮病毒(Citrus psorosis virus,CPV)属蛇形病毒属(Ophiovirus),是一种多分体单链RNA病毒,主要分布于阿根廷、巴西、意大利、西班牙以及美国等国家,对柑桔产业造成十分严重的为害。该病害可以随种子、苗木等繁殖材料的调运进行远距离传播,鉴于目前我国大量引进国外优良柑桔品种,存在着将柑桔鳞皮病传入我国的风险,所以迫切需要建立一种快速、准确的CPV检测方法,该方法的建立对加强检疫、保障我国柑桔产业不受该外来重大植物病害的危害,保持我国柑桔产业的可持续发展显得尤为重要。 目前国外对CPV的检测方法主要有指示植物鉴定、血清学检测、分子杂交检测以及反转录-多聚酶链式反应(RT-PCR)等,而国内迄今还未见相关的研究报道。本研究通过对中国农业科学院柑桔研究所保存的CPV毒源进行研究,比较筛选了一种微量快速总核酸提取方法,建立起快速、灵敏、特异性的CPV RT-PCR检测方法,并对Dweet桔橙病株上不同部位CPV的全年分布进行了检测,主要结论如下: 1.比较分析了浸泡法、Trizol法和微量快速提取法在内的3种总核酸提取方法,结果表明:浸泡法提取液中A260/A280平均值为1.26,并且RT-PCR效果差;Trizol法提取液中A260/A280程序较0平均值为1.77,RT-PCR效果好,但提取操作复杂,不适合大批量样品RNA的快速制备;微量快速提取法提取液中A260/A280平均值为1.89,PCR效果好,并且提取速度快、取样量少,适用于大批量样品RNA的快速制备。 2.进行了常规RT-PCR和一步法RT-PCR的优化实验。对常规RT-PCR进行了退火温度、Mg2+浓度、引物浓度的优化,最终可以检测出病株中的CPV,但是结果中仍有非特异性条带;对一步法RT-PCR试剂盒进行比较,结果表明SuperScript One-Step RT-PCR试剂盒扩增出的条带清晰,无非特异性条带产生,适合CPV的RT-PCR检测;再对该方法进行优化,优化后的一步法RT-PCR方法灵敏度高,特异性强。 3.运用一步法RT-PCR对嫁接接种CPV的Dweet桔橙、Symons甜橙、新生3号椪柑、邓肯葡萄柚、尤里克柠檬和强德勒柚等病株进行检测,均能检测到CPV,可见,一步法RT-PCR适合于不同柑桔品种的CPV检测。 4.从2005年5月到2006年4月逐月采样,运用一步法RT-PCR检测CPV在Dweet桔橙苗木叶片和枝皮中的分布,同时记录月平均温度。结果表明,保存在温室中的Dweet桔橙病
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