基于“以乡镇为主”农村义务教育管理体制的种种弊端,严重阻碍了农村义务教育的全面协调发展。2001年5月,国务院实施“由地方政府负责,分级管理,以县为主”的农村义务教育管理新体制。在实施“以县为主”管理体制的过程中,虽然我国实施“以县为主”管理体制已做了大量的工作,但作为农村义务教育新的管理形式,仍存着一些亟待完善的地方,需要在实践过程中不断总结、改进和提高。本文采用文献法与调查研究法,对当前我国农村义务教育发展过程中存在的主要问题展开研究。从目前情况看,问题主要表现在：(一)管理体制事权不对等、重心不当；(二)教育投入仍然不足；(三)；教育资源配置不公平；(四)教师队伍有待进一步稳定与提高；(五)素质教育无法落实、应试教育愈演愈烈；(六)学校安全存在隐患等。造成这些问题的原因是多方面,包括义务教育的属性和经济、政治、文化、社会等因素。在这种情况下,要更好地推进农村义务教育,需要在诸多方面进一步努力,主要有：(一)理顺管理体制,扩大学校办学自主权；(二)加大整体投入比例,使投入重心适度倾斜农村；(三)层层落实农村义务教育优先发展的战略地位；(四)以教师为本,加强教师队伍建设。(五)转变教育理念,推行素质教育；(六)强化责任,完善校园安全综合管理体系。