近年来，中央和地方政府将农民专业合作社同“精准扶贫”、“土地改革”等解决“三农”问题的扶贫政策结合起来，用扶贫资金向合作社注资、打破农村土地使用权流转壁垒、变农民为股民等措施，促进农民专业合作社健康有序发展。六盘水市政府正是在这个大背景下，响应中央号召，因地制宜地提出农村“三变”改革方案。方案实施三年以来成绩显著，极大地改善了当地农村贫困人口的生活现状。　　本文以六盘水市农民专业合作社为主要研究对象，通过实地调研、理论研究等方式深刻剖析农民专业合作社这一法人组织，对其法人治理结构的特性、当前存在的问题和完善建议做详细阐释，旨在为改善农民专业合作社法人治理结构现状、使合作社规范有序发展提供可行性建议。笔者采用传统“问题-原因-对策”三段论的论文写作方式，理论分析贯穿文章始终，同时还配有适当的数据分析，使文章论证丰富，有理有据。　　文章主要有三个部分构成：1、第一章阐释农民专业合作法人治理结构的理论基础。2、第二章分析六盘水市农民专业合作社法人治理结构存在的问题，主要是基于《六盘水市“三变”改革资料汇编》、30家农民专业合作社调研数据等资料统计分析的结果，归纳出内部人控制占主导、合作社设立门槛低、缺乏激励机制、法人治理机制不健全等问题；3、第三章主要基于第二章合作社发展存在的问题的基础上，从农民专业合作社法人治理结构机制、规则体系和资金渠道三个方面探索完善建议：完善合作社法人治理机制，建立决策、执行和监督“三权分立”体制；完善农民专业合作社法人治理规则体系，在合作社章程中建立公积金提取制度和经营管理人员激励机制，在合作社法中建立合作社联社制度，提高合作社抗风险能力；扩充合作社资金来源渠道，破解合作社发展面临的资金困境。