黄瓜染色体片段替换系构建及果形相关QTL定位

来源 :山东农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:oyxz1988
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黄瓜(Cucumis sativus L.,2n=14)作为一种重要的经济作物在我国被广泛种植。果形是影响黄瓜商品性的重要因素,受多个数量性状位点(QTL)调控且易受环境条件的影响。本研究通过构建染色体片段替换系(CSSLs)将控制果形的基因分离到不同株系中,使多基因控制的数量性状变成单基因控制的质量性状,然后对黄瓜果形相关QTL/基因进行定位,进而深入解析黄瓜果形调控机制。首先对黄瓜自交系CNS21(长果)和RNS7(圆果)进行表型鉴定。通过在温室中两季种植发现,RNS7子房长度在1 cm左右,果形指数在1.11.3之间;商品瓜长度在5 cm左右,果形指数约为1;成熟瓜长度810 cm,果形指数在0.71.0之间。CNS21子房长度56 cm(果形指数1112);商品瓜时期果实细长,长度3540 cm(果形指数约为10);成熟瓜长度5060 cm(果形指数约为10)。关于果刺性状,CNS21为白色,果刺密度稀;RNS7为黑色,刺的密度较CNS21更少。在果皮颜色方面,CNS21和RNS7在开花当天均为翠绿色;在商品瓜时期,CNS21为深绿色,RNS7果皮颜色为淡绿色;到生育成熟时,CNS21果皮为黄色,而RNS7为棕色。此外,CNS21和RNS7在茎的形状、雄蕊和雌蕊的形状、叶片形状以及种子大小方面也存在显著差异。然后,根据用CNS21和RNS7的重测序数据构建了一个由114个InDel(插入或缺失)标记组成的覆盖黄瓜全基因组的遗传图谱,其中1号染色体上开发了18个标记,2号染色体上16个,3号染色体上19个,4号染色体上14个,5号染色体上19个,6号染色体上17个,7号染色体上11个,InDel标记之间的平均距离约为1.68 Mb。接下来利用CNS21(供体亲本)和RNS7(受体亲本)杂交得到F1代,再经过四次回交得到BC4F1,BC4F1自交得到BC4F2。采用如下标准对回交群体和自交群体进行InDel标记辅助选择(MAS):I)RNS7的染色体片段被来自CNS21的多个短的同源片段替换;II)替换系的遗传背景与RNS7具有高度同源性;III)每个替换株系的替换片段之间存在部分重叠区域。最终从1980棵BC4F2群体中挑选出79个株系组成黄瓜染色体片段替换系,共包含85个替换片段,其中73个为单片段替换株系,6个双片段替换株系。最终利用染色体片段替换系定位到与子房长度(OVL)、子房横径(OVD)、商品瓜长度(FL)、商品瓜横径(FD)、成熟瓜长度(MFL)、成熟瓜横径(MFD)相关的19个QTLs,其中12个为主效QTL,7个为微效QTL。此外还定位到与果皮颜色(PC)、果肉颜色(FC)、果刺颜色(SC)、种子长度(SL)、种子宽度(SD)相关的5个QTLs。
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