白念珠菌菌丝相全长cDNA文库的构建及鉴定

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目的:构建白念珠菌菌丝相的全长cDNA文库。  方法:复苏液氮冻存白念珠菌标准菌株 ATCC-90028;动物接种毒力恢复;兔感染组织培养酵母菌落,鉴定并筛选出白念珠菌单菌落;不完全 RMPI-1640培养基诱导白念珠菌带芽管孢子;液氮研磨法对白念珠菌带芽管孢子进行破壁,TRNzol试剂提取总 RNA;OligotexTM-dT30 mRNA Purification Kit纯化mRNA;应用SMART技术构建白念珠菌菌丝相全长cDNA文库:利用SMARTScribeTM MMLV反转录酶和经修饰的oligo(dT)引物(CDSⅢ/3’PCR引物)合成第一链cDNA,SMARTⅣTM寡核苷酸作为 mRNA5’端延伸出去的模板,采用 LD-PCR合成双链 cDNA,经蛋白酶 K消化、SfiⅠ酶切及过柱分级分离后,与λTriplE×2载体连接,重组质粒转化大肠杆菌E.coli XL1-Blue,库容量计算,PCR测定插入片段大小,检测文库质量。  结果:芽管诱导率最高可达95%以上;总RNA溶液A260/A280为1.87,浓度为295.67μg/ml,1.1%琼脂糖/EtBr凝胶电泳结果显示28S和18S较亮,28S条带的亮度接近18S条带亮度的两倍,5S隐约可见;mRNA溶液A260/A280为1.85,浓度为41.47μg/ml,1.1%琼脂糖/EtBr凝胶电泳结果显示 mRNA在300bp至10000bp以上的范围呈smear分布;构建好的原始文库滴度为1.87×107pfu/ml,重组率达100%,库容量9.35×106;文库扩增后,滴度达5×109 pfu/ml,插入cDNA长度多在0.4~2.5Kb,平均长度在1.5Kb左右。  结论:实验中白念珠菌带芽管孢子的诱导率达到提取菌丝相总RNA的要求;所提取的总RNA分子完整、降解少,从中纯化的mRNA浓度及完整性符合建库要求;以高质量的mRNA为模板所建文库的代表性好和重组片段的序列完整性高,成功的构建了白念珠菌菌丝相全长cDNA文库。为进一步筛选和克隆白念珠菌芽管特异性抗原表达基因及致病性相关基因奠定了基础。
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