在我国金融业分业经营体制之下，随着金融市场竞争的日益激烈，不同金融企业之间的新金融服务产品的合作创新活动也逐渐活跃起来，成为金融企业增强自身创新力的一个重要途径。对于金融服务业，这个特殊的知识密集型服务业而言，对合作创新项目绩效影响因素及其内在机理的实证研究就显得十分迫切而重要。本研究以商业银行为主体的金融企业间服务合作创新项目作为研究对象，在现有技术合作创新和服务创新相关研究文献的基础上，通过访谈研究梳理出了金融企业合作创新中的两个要素，即知识流转和服务过程合作。随后，本文提出了金融服务合作创新机理的概念模型，全面地研究了金融服务合作创新影响因素、知识流转、服务过程合作对服务合作创新绩效的影响关系，并着重分析了知识流转和服务过程合作的中介作用。本研究采用问卷调查，对163份有效回收问卷结果进行因子分析，并利用AMOS软件对概念模型进行了验证性因子分析，最后采用回归分析方法对模型所包含的假设进行实证检验。验证了合作能力、伙伴关系、团队建设、技术保障、项目支持以及界面沟通六个方面对合作创新绩效的影响，还验证了知识流转和服务过程合作在其中起到的中介作用。最后，根据研究得出的理论结果，对提高合作创新效率及绩效提出了一些实践指导建议。