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新城疫病毒（Newcastle Disease Virus，NDV）属于副粘病毒科（Paramyxoviridae）副粘病毒亚科（Paramyxovirinae）腮腺炎病毒属（Rubulavirus）的成员，其主要结构蛋白融合蛋白（F）和血凝素-神经氨酸酶（HN）与其致病性密切相关。目前，在我国ND免疫预防的过程中，发现常规疫苗对于我国的流行毒株有时不能提供良好的免疫保护，因此寻找一种有效的疫苗是当务之急。研究发现，如果能够确定病毒蛋白的抗原表位，将几个病毒株的表位结合在一起，使其产生对不同毒株的抵抗，就可以达到理想的保护效果。因此，ND表位的研究正是优化疫苗的最佳途径。 本研究首先分析了NDV国内流行毒株F基因的核苷酸序列特点，根据已知NDV F基因1-374位核苷酸绘制了系统发育进化树，发现近年来在我国出现的流行株多数都属于基因Ⅶ型。比较基因Ⅶ型各毒株之间核苷酸序列，发现各毒株之间同源率在91.7％-99.7％之间，在本实验室分离并保留的毒株中，GX-2-98与其他各毒株之间同源率多数是在95％以上，具有良好的代表性。因此，我们选取分离株GX-2-98进行有关ND表位的研究。 利用所设计的引物分别扩增得到GX-2-98毒株的F基因和HN基因的cDNA片段（分别命名为Fa、Fb、HNa），以及NDV分离株SHX-3-99、HLJ-4-95、QH-2-84、GX-5-97 HN片段。根据29株NDV HN基因部分编码序列绘制NDV系统发育进化树，发现F及HN基因的分型结果大致相同。 利用Dnastar软件分析了NDV GX-2-98株糖蛋白表位的分布，其中F蛋白上有T细胞表位11处，B细胞表位8处；HN蛋白1-165位氨基酸的T细胞表位4处，B细胞表位2处。在氨基酸水平上，基因Ⅶ型HN基因的第65-81位氨基酸较为保守，与其它各型均不相同（毒株TW95除外）。 在表位预测的基础上，将临近的表位合并，设计引物并引入酶切位点，以Fa、Fb、HNa为模板扩增含抗原表位的多肽片段F1、F2、F3、F4、HN1，克隆到原核表达载体pPROEXHT上，成功地构建了五个表达载体。经测序鉴定与原序列没有突变及移码后，经IPTG诱导，有四段含表位的多肽获得了表达。本研究为国内NDV基因Ⅶ型分离株F、HN蛋白特异性表位的鉴定以及ND表位疫苗的研制奠定了基础。